| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 297,509 | G→C | G30G (GGC→GGG) | paoB ← | aldehyde oxidoreductase FAD‑binding subunit PaoB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 297,509 | 0 | G | C | 100.0% | 39.9 / NA | 13 | G30G (GGC→GGG) | paoB | aldehyde oxidoreductase FAD‑binding subunit PaoB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (5/8); total (5/8) | |||||||||||
GCCCGAGGCCGTTCACATCGATAAGGTGGGTGGGCGTTTCAATTTCCAGCTTCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAA > NZ_CP009273/297433‑297589 | gCCCGAGGCCGTTCACATCGATAAGGTGGGTGGGCGTTTCAATTTCCAGCTTCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCCCCCGCGATAAAtt > 2:101762/1‑90 (MQ=255) gCCGTTCACATCGATAAGGTGGGTGGGCGTTTCAATTTCCAGCTTCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCCCCCGCGATAAATTTTGCGcc < 1:213965/90‑1 (MQ=255) gTTCACATCGATAAGGTGGGTGGGCGTTTCAATTTCCAGCTTCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCCCCCGCGATAAATTTTGCGCCggg > 2:147927/1‑90 (MQ=255) tgggtgggCGTTTCAATTTCCAGCTTCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCCCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTa < 2:74500/90‑1 (MQ=255) tttCAATTTCCAGCTTCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCCCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCt < 2:208643/90‑1 (MQ=255) ttCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCCCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTc < 1:304876/90‑1 (MQ=255) atcaGGTCCAGCAGATTGGTCCCCCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACt > 1:41876/1‑90 (MQ=255) tcaGGTCCAGCAGATTGGTCCCCCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTc < 1:203514/90‑1 (MQ=255) gTCCAGCAGATTGGTCCCCCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTc < 1:37176/90‑1 (MQ=255) tCCAGCAGATTGGTCCCCCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCa > 2:200782/1‑90 (MQ=255) aTTGGTCCCCCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTaaa < 2:37613/90‑1 (MQ=255) ttGGTCCCCCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTgg < 1:354066/65‑1 (MQ=255) ttGGTCCCCCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTgg > 2:354066/1‑65 (MQ=255) | GCCCGAGGCCGTTCACATCGATAAGGTGGGTGGGCGTTTCAATTTCCAGCTTCATCAGGTCCAGCAGATTGGTCCCGCCCGCGATAAATTTTGCGCCGGGTACGCGCTGAGCGCTAAGTGCCGCCTCGGCTGGGGTATTCACTCGTTCATAGGTAAA > NZ_CP009273/297433‑297589 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |