Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	2767751	2767811	61	10 [0]	[5] 7	BW25113_RS13770	hypothetical protein

ATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTATACATAC  >  NZ_CP009273/2767661‑2767750                                                                                          | aTAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTatacatac  <  1:1234119/90‑1 (MQ=255) aTAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTatacatac  <  1:1425369/90‑1 (MQ=255) aTAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTatacatac  <  1:1649380/90‑1 (MQ=255) aTAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTatacatac  <  1:201751/90‑1 (MQ=255) aTAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTatacatac  <  1:258802/90‑1 (MQ=255) aTAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTatacatac  <  2:32135/90‑1 (MQ=255) aTAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTatacatac  <  2:765377/90‑1 (MQ=255) aTAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTatacatac  <  2:89205/90‑1 (MQ=255)                                   ttGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTatacatac  >  1:1456029/1‑56 (MQ=255)                                   ttGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTatacatac  <  2:1456029/56‑1 (MQ=255)                                                                                          | ATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTATACATAC  >  NZ_CP009273/2767661‑2767750

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑