Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	993098	993137	40	3 [0]	[0] 2	ssuE/elfA	NADPH‑dependent FMN reductase/fimbrial protein

TAGATGTTGAATCAATGAATTACTCGTTCAGTTAATATTTAAATATTCATGAAATCTATAAATTAAAGATTTGTCACTTATT  >  NZ_CP009273/993138‑993219 |                                                                                  tAGATGTTGAATCAATGAATTACTCGTTCAGTTAATATTTAAATATTCATGAAATCTATAAATTAAAGATTTGTCACTTAtt  >  1:85217/1‑82 (MQ=255) tAGATGTTGAATCAATGAATTACTCGTTCAGTTAATATTTAAATATTCATGAAATCTATAAATTAAAGATTTGTCACTTAtt  <  2:85217/82‑1 (MQ=255) |                                                                                  TAGATGTTGAATCAATGAATTACTCGTTCAGTTAATATTTAAATATTCATGAAATCTATAAATTAAAGATTTGTCACTTATT  >  NZ_CP009273/993138‑993219

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑