Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	1459453	1459486	34	4 [3]	[3] 4	BW25113_RS25580	hypothetical protein

TGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATT  >  NZ_CP009273/1459363‑1459457                                                                                          |      tGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTg       <  2:533470/90‑1 (MQ=255)     tAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAAt   >  1:646340/1‑90 (MQ=255)                  atttatttGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAAtt  <  1:1028494/78‑1 (MQ=255)                  atttatttGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAAtt  >  2:1028494/1‑78 (MQ=255)                                                                                          |      TGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATT  >  NZ_CP009273/1459363‑1459457

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑