Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	2897140	2897184	45	2 [1]	[1] 2	ygcE/queE	FGGY‑family carbohydrate kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE

AGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCAT  >  NZ_CP009273/2897182‑2897274    |                                                                                          aGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTgg     <  2:358541/90‑1 (MQ=255)    ttAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTCTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCAt  <  2:164123/90‑1 (MQ=255)    |                                                                                          AGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCAT  >  NZ_CP009273/2897182‑2897274

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑