Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	2078985	2079002	18	2 [0]	[1] 3	yeeE	thiosulfate utilization transporter TsuA/YeeE

AAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTA  >  NZ_CP009273/2079000‑2079089    |                                                                                       aaaaCATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTa  <  2:376093/90‑1 (MQ=255)    aCATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTa  <  1:27617/87‑1 (MQ=255)    aCATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTa  >  2:27617/1‑87 (MQ=255)    |                                                                                       AAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTA  >  NZ_CP009273/2079000‑2079089

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑