Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 2,432,392 | A→G | I322V (ATT→GTT) | flk → | flagella biosynthesis regulator Flk |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 2,432,392 | 0 | A | G | 100.0% | 65.4 / NA | 19 | I322V (ATT→GTT) | flk | flagella biosynthesis regulator Flk |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (13/6); total (13/6) |
AACCGCTGCTTAATCCTTTTCCACCGATGATGGACACGTTGCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGATTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACAATAATACCCAGCACCGCAGAG > NZ_CP009273/2432306‑2432472 | aaCCGCTGCTTAATCCTTTTCCACCGATGATGGACACGTTGCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGGTTa < 2:31336/90‑1 (MQ=255) gctgctTAATCCTTTTCCACCGATGATGGACACGTTGCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGGTTATCCt < 2:401676/90‑1 (MQ=255) tgctTAATCCTTTTCCACCGATGATGGACACGTTGCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGGTTATCCTGa > 1:88865/1‑90 (MQ=255) tttCCACCGATGATGGACACGTTGCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTctgg > 1:155761/1‑90 (MQ=255) tGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTa > 1:18972/1‑90 (MQ=255) tGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTa > 1:218330/1‑90 (MQ=255) gCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATc > 2:396930/1‑90 (MQ=255) gcgTCCCGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGAc > 1:498018/1‑90 (MQ=255) ccGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACaataa < 1:193488/90‑1 (MQ=255) ccGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACaataa < 1:396930/90‑1 (MQ=255) ccGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACaataa < 2:368239/90‑1 (MQ=255) cTGTGGATACTGTTAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACAATAATAccc < 1:293481/90‑1 (MQ=255) aCTGTTAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACAATAATACCCAGCACCGc > 2:489062/1‑90 (MQ=255) ttAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACAATAATACCCAGCACCGCagag > 2:270115/1‑90 (MQ=255) ttAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACAATAATACCCAGCACCGCagag > 2:240523/1‑90 (MQ=255) ttAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACAATAATACCCAGCACCGCagag > 2:14934/1‑90 (MQ=255) ttAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACAATAATACCCAGCACCGCagag > 1:360541/1‑90 (MQ=255) ttAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACAATAATACCCAGCACCGCagag > 1:271900/1‑90 (MQ=255) ttAGTCGCGGTTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACAATAATACCCAGCACCGCagag > 1:157016/1‑90 (MQ=255) | AACCGCTGCTTAATCCTTTTCCACCGATGATGGACACGTTGCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGATTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACAATAATACCCAGCACCGCAGAG > NZ_CP009273/2432306‑2432472 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |