| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 3,401,936 | T→C | F324S (TTC→TCC) | panF → | sodium/pantothenate symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 3,401,936 | 0 | T | C | 100.0% | 77.0 / NA | 22 | F324S (TTC→TCC) | panF | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (10/12); total (10/12) | |||||||||||
GGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTC > NZ_CP009273/3401849‑3402018 | gggCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTccc < 2:491908/90‑1 (MQ=255)gggCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTccc > 2:483029/1‑90 (MQ=255) ggTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGc < 1:508215/90‑1 (MQ=255) tGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACaa > 2:318681/1‑90 (MQ=255) gTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAAtt > 2:217369/1‑90 (MQ=255) tCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGAt < 2:399018/64‑1 (MQ=255) tCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGAt > 1:399018/1‑64 (MQ=255) aCGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTa < 2:429401/82‑1 (MQ=255) aCGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTa > 1:429401/1‑82 (MQ=255) cGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAAc < 1:231787/90‑1 (MQ=255) cGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAAc < 1:253203/90‑1 (MQ=255) aaTGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAActgct > 2:362420/1‑90 (MQ=255) gTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCaa < 1:362420/90‑1 (MQ=255) gTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCaa < 2:435618/90‑1 (MQ=255) tAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCaaa < 1:483029/90‑1 (MQ=255) tAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCaaa > 2:132552/1‑90 (MQ=255) aaaaGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAg > 1:77727/1‑90 (MQ=255) gctgcCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGc > 1:473160/1‑90 (MQ=255) tgcCACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTa > 2:43814/1‑90 (MQ=255) cACCGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGa < 1:290588/90‑1 (MQ=255) cGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACa > 2:241888/1‑53 (MQ=255) cGTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACa < 1:241888/53‑1 (MQ=255) gTTTGCTGCCGGGATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCAt < 1:2245/90‑1 (MQ=255) gggATCTCCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGAtctc < 1:475400/90‑1 (MQ=255) | GGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTC > NZ_CP009273/3401849‑3402018 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |