Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 3,527,973 | T→C | M419V (ATG→GTG) | envZ ← | two‑component system sensor histidine kinase EnvZ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 3,527,973 | 0 | T | C | 100.0% | 45.9 / NA | 14 | M419V (ATG→GTG) | envZ | two‑component system sensor histidine kinase EnvZ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (6/8); total (6/8) |
TGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAA > NZ_CP009273/3527892‑3528032 | tGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGTTAt < 1:182706/90‑1 (MQ=255) tGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGTTAt > 2:24314/1‑90 (MQ=255) tGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGTTAt > 2:364218/1‑90 (MQ=255) gcgcCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGTTATGGTTAt > 1:119540/1‑90 (MQ=255) cgcCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGTTATGGTTATc < 1:24314/90‑1 (MQ=255) ttACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGTTATGGTTATCCACGATAc < 2:361523/90‑1 (MQ=255) gAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGt > 1:388541/1‑48 (MQ=255) gAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGt < 2:388541/48‑1 (MQ=255) gAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTg < 1:9534/90‑1 (MQ=255) aaGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGcc > 1:167314/1‑90 (MQ=255) aaGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGcc < 1:364218/90‑1 (MQ=255) cgccccgcTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTaa < 2:126405/90‑1 (MQ=255) ctcgctGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGTTATGGTTATc < 1:102941/39‑1 (MQ=38) ctcgctGGTGCCAAGCTCCAGCACCCCGTTATGGTTATc > 2:102941/1‑39 (MQ=38) | TGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAA > NZ_CP009273/3527892‑3528032 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |