| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 3,680,898 | T→C | R546G (AGA→GGA) | bcsC ← | cellulose synthase complex outer membrane protein BcsC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 3,680,898 | 0 | T | C | 100.0% | 62.0 / NA | 18 | R546G (AGA→GGA) | bcsC | cellulose synthase complex outer membrane protein BcsC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (5/13); total (5/13) | |||||||||||
CGCTTTGCAGTCGATTAACCAGCTCCTGAATATTGCTGTTCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCTGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATT > NZ_CP009273/3680814‑3680983 | cGCTTTGCAGTCGATTAACCAGCTCCTGAATATTGCTGTTCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCt < 2:320061/90‑1 (MQ=255) cAGTCGATTAACCAGCTCCTGAATATTGCTGTTCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATg < 1:93485/90‑1 (MQ=255) gATTAACCAGCTCCTGAATATTGCTGTTCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCag < 1:208050/90‑1 (MQ=255) gATTAACCAGCTCCTGAATATTGCTGTTCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCag < 1:375761/90‑1 (MQ=255) gATTAACCAGCTCCTGAATATTGCTGTTCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCag < 1:488195/90‑1 (MQ=255) ttAACCAGCTCCTGAATATTGCTGTTCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCagag < 2:475557/90‑1 (MQ=255) aaTATTGCTGTTCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTa < 1:216687/90‑1 (MQ=255) gCTGTTCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTa > 2:10447/1‑90 (MQ=255) gTTCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTAAAc > 2:40773/1‑90 (MQ=255) ttCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTAAAcc < 1:355466/90‑1 (MQ=255) ttCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTAAAcc < 2:461693/90‑1 (MQ=255) gcACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTAAAcc < 2:332781/81‑1 (MQ=255) gcACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTAAAcc > 1:332781/1‑81 (MQ=255) gCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCg < 2:261035/90‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACt > 1:353519/1‑78 (MQ=255) gcgcCAGCGCCGCTCCGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACt < 2:353519/78‑1 (MQ=255) gccgcTCCGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTgcgc < 2:302922/90‑1 (MQ=255) gcTCCGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCAtt > 2:255624/1‑90 (MQ=255) | CGCTTTGCAGTCGATTAACCAGCTCCTGAATATTGCTGTTCCACTGCGCACGCGGCAGGCTATTGATATGCGCCAGCGCCGCTCTGTCCTGGTCATGACCAGAGAGGTACAGCCCGTAAGCGTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATT > NZ_CP009273/3680814‑3680983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |