| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 3,737,651 | A→G | intergenic (+81/‑37) | yiaL → / → yiaM | YhcH/YjgK/YiaL family protein/2,3‑diketo‑L‑gulonate TRAP transporter small permease YiaM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 3,737,651 | 0 | A | G | 100.0% | 42.9 / NA | 13 | intergenic (+81/‑37) | yiaL/yiaM | YhcH/YjgK/YiaL family protein/2,3‑diketo‑L‑gulonate TRAP transporter small permease YiaM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (4/9); total (4/9) | |||||||||||
AATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTAC > NZ_CP009273/3737565‑3737733 | aaTTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGGCtt < 1:176421/90‑1 (MQ=255) ttAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATACGGCTTGa < 2:293755/90‑1 (MQ=255) ataatCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGGCTTGAATTATgac < 2:458897/90‑1 (MQ=255) gTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTCTATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGGCTTGAATTATGACAGACAt < 1:467783/90‑1 (MQ=255) gTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGGCTTGAATTATGACAGACAt < 2:1490/90‑1 (MQ=255) aCGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGGCTTGAATTATGACAGACATAGcc > 2:222069/1‑90 (MQ=255) aTTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGGCTTGAATTATGACAAACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAAt > 2:446854/1‑90 (MQ=255) ctctAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGGCTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTc < 1:246522/90‑1 (MQ=255) ctctAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGGCTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTc < 2:63261/90‑1 (MQ=255) tatTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGGCTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATa > 1:433644/1‑90 (MQ=255) ataatTCAGGTTGCTGCACATGCGGCTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTgg > 1:439576/1‑89 (MQ=255) ataatTCAGGTTGCTGCACATGCGGCTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTgg < 2:439576/89‑1 (MQ=255) acaTGCGGCTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAACAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTAc < 1:460469/90‑1 (MQ=255) | AATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTAC > NZ_CP009273/3737565‑3737733 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |