Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	1459458	1459473	16	2 [1]	[1] 2	BW25113_RS25580	hypothetical protein

AAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTT  >  NZ_CP009273/1459368‑1459458                                                                                          |  aaGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAAtt   <  1:243702/90‑1 (MQ=255)  aGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAAttt  >  2:151632/1‑90 (MQ=255)                                                                                          |  AAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTT  >  NZ_CP009273/1459368‑1459458

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑