Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	716523	716545	23	5 [1]	[0] 2	kdpE	two‑component system response regulator KdpE

TGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGAT  >  NZ_CP009273/716439‑716528                                                                                    |       tgttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGAt  <  1:321510/90‑1 (MQ=255)                   gTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATaa        <  1:402676/66‑1 (MQ=255)                   gTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATaa        >  2:402676/1‑66 (MQ=255)                              taCGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATaa        <  1:372040/55‑1 (MQ=255)                              taCGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATaa        >  2:372040/1‑55 (MQ=255)                                                                                    |       TGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGAT  >  NZ_CP009273/716439‑716528

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑