Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	3112321	3112332	12	2 [0]	[0] 2	sslE	lipoprotein metalloprotease SslE

CTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGAT  >  NZ_CP009273/3112231‑3112320                                                                                          | cTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGAt  >  1:196175/1‑90 (MQ=255) cTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGAt  >  2:234362/1‑90 (MQ=255)                                                                                          | CTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGAT  >  NZ_CP009273/3112231‑3112320

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑