| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 750,281 | A→G | intergenic (‑44/‑337) | BW25113_RS25495 ← / → sdhC | hypothetical protein/succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 750,281 | 0 | A | G | 100.0% | 51.4 / NA | 14 | intergenic (‑44/‑337) | BW25113_RS25495/sdhC | hypothetical protein/succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (5/9); total (5/9) | |||||||||||
AGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAA > NZ_CP009273/750205‑750360 | aGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGGTTGTCAAATTAga > 2:32784/1‑90 (MQ=255) ggTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGGTTGTCAAATTAgat < 1:1053550/90‑1 (MQ=255) aaTACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGGTTGTCAAATTAGATGATTa < 1:259983/90‑1 (MQ=255) aaTACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGGTTGTCAAATTAGATGATTa < 2:341075/90‑1 (MQ=255) aaCTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGGTTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTaaataaat < 1:278015/90‑1 (MQ=255) tttACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGGTTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAAtgttg > 1:605457/1‑90 (MQ=255) tttACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGGTTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAAtgttg > 1:658017/1‑90 (MQ=255) atGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGGTTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCt < 2:1021543/90‑1 (MQ=255) gCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGGTTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTgg < 1:846347/90‑1 (MQ=255) ttCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGGTTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCa > 2:21822/1‑90 (MQ=255) cTTTGTTGAATGGTTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACa < 1:21822/90‑1 (MQ=255) ttgttgAATGGTTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACaaa < 2:605457/90‑1 (MQ=255) ttgttgAATGGTTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACaaa < 2:658017/90‑1 (MQ=255) ttgttgAATGGTTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACaaa > 2:78886/1‑90 (MQ=255) | AGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAA > NZ_CP009273/750205‑750360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |