Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	993889	993914	26	2 [0]	[1] 5	elfA/elfD	fimbrial protein/molecular chaperone

ATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAA  >  NZ_CP009273/993829‑993888                                                            | aTGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTattaa  >  1:313940/1‑60 (MQ=255) aTGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTattaa  <  2:313940/60‑1 (MQ=255)                                                            | ATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAA  >  NZ_CP009273/993829‑993888

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑