| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | = 4048248 | 106 (1.390) | 3 (0.040) | 3/162 | 4.4 | 2.9% | coding (391/1410 nt) | glnG | nitrogen regulation protein NR(I) |
| ? | NZ_CP009273 | 4048254 = | 101 (1.360) | coding (385/1410 nt) | glnG | nitrogen regulation protein NR(I) | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CGAAAGCCGACCGATAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACGGTTTGGGCAGATAATCAA > NZ_CP009273/4048165‑4048343 | cgAAAGCCGACCGATAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTAcg < 2:1362580/90‑1 (MQ=255) aaaGCCGACCGATAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTAcgcg > 2:739323/1‑90 (MQ=255) aaaGCCGACCGATAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTAcgcg < 1:1790873/90‑1 (MQ=255) gCCGACCGATAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGgct < 2:1079399/90‑1 (MQ=255) gaccgaTAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGgctgct > 1:1179571/1‑90 (MQ=255) ccgaTAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGgctgctgc < 1:715513/90‑1 (MQ=255) ccgaTAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGgctgctgc < 1:1665947/90‑1 (MQ=255) ccgaTAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGgctgctgc < 1:1130757/90‑1 (MQ=255) ccgaTAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGgctgctgc < 1:2206290/90‑1 (MQ=255) gaTAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGctgctgctg > 2:630682/1‑90 (MQ=255) gaTAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGctgctgctg < 2:1408948/90‑1 (MQ=255) ataCGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTcc < 1:1187618/90‑1 (MQ=255) cGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTgg > 2:1297721/1‑90 (MQ=255) cGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTgg > 1:2268502/1‑90 (MQ=255) aaCACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTaa < 1:934545/90‑1 (MQ=255) aaCACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTaa < 2:1158509/90‑1 (MQ=255) aaCACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTaa < 1:1063378/90‑1 (MQ=255) aaCACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTaa < 2:1473372/90‑1 (MQ=255) aaCACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTaa < 1:1122407/90‑1 (MQ=255) aaCACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTaa > 1:1158509/1‑90 (MQ=255) aaCACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTaa > 1:1417421/1‑90 (MQ=255) acacGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGgctgctgc > 1:524361/1‑77 (MQ=255) acacGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGgctgctgc < 2:524361/77‑1 (MQ=255) acacGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAAt > 1:1901753/1‑90 (MQ=255) acacGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAAt > 1:562835/1‑90 (MQ=255) acacGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAAt > 1:589757/1‑90 (MQ=255) acacGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAAt > 1:1695636/1‑90 (MQ=255) cacGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATg < 1:1957264/90‑1 (MQ=255) cGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGgctgctgc > 1:1835563/1‑74 (MQ=255) cGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGAc > 2:1380349/1‑90 (MQ=255) cGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGAc > 2:1074446/1‑90 (MQ=255) cGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTCGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGAc > 1:2065630/1‑90 (MQ=255) gTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTAcgcg < 2:280403/65‑1 (MQ=255) gTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACt > 1:957410/1‑90 (MQ=255) tGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATa > 2:1167944/1‑90 (MQ=255) tGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATa > 1:983225/1‑90 (MQ=255) tGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATa > 2:1132469/1‑90 (MQ=255) tGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATa > 1:1314057/1‑90 (MQ=255) tGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATa > 2:46715/1‑90 (MQ=255) tGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATa > 1:983224/1‑90 (MQ=255) cATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAgc < 1:1026350/90‑1 (MQ=255) cATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAgc < 2:891325/90‑1 (MQ=255) cATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAgc < 1:1892086/90‑1 (MQ=255) cATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAgc < 2:495384/90‑1 (MQ=255) ggctggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTcc < 2:868778/70‑1 (MQ=255) ggctggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTcc > 1:868778/1‑70 (MQ=255) ggctggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAgcgcg > 2:203205/1‑90 (MQ=255) ggctggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGA‑‑‑‑‑ACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCaa > 2:1089269/1‑90 (MQ=255) gctggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAgcgcgc > 1:381284/1‑90 (MQ=255) gctggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAgcgcgc > 2:1802860/1‑90 (MQ=255) gctggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAgcgcgc > 2:2050807/1‑90 (MQ=255) gctggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAgcgcgc < 1:1729236/90‑1 (MQ=255) tggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTc < 1:1132469/90‑1 (MQ=255) tggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTc < 1:1380349/90‑1 (MQ=255) ggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTaa > 2:147474/1‑72 (MQ=255) ggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTaa < 1:147474/72‑1 (MQ=255) ggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCa > 1:538091/1‑90 (MQ=255) ggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCa > 2:1177567/1‑90 (MQ=255) ggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCa > 2:1036692/1‑90 (MQ=255) ggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCa > 1:1904153/1‑90 (MQ=255) ggcGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCCGGTAATGACTGATAGCGCGCTCa > 2:1141596/1‑90 (MQ=255) ttCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAg > 1:758236/1‑90 (MQ=255) tCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACGTTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAgc < 1:1267148/90‑1 (MQ=255) tCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAgc > 2:1622486/1‑90 (MQ=255) tCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAgc > 2:471181/1‑90 (MQ=255) cGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAgcgcgc > 1:338367/1‑80 (MQ=255) cGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAgcgcgc < 2:338367/80‑1 (MQ=255) ccGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGcc < 2:1695636/90‑1 (MQ=255) cGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCa > 2:599422/1‑90 (MQ=255) gatgatATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCAc < 1:1821437/90‑1 (MQ=255) gatgatATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCAc < 1:1466816/90‑1 (MQ=255) gatgatATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGA‑‑‑‑‑ACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCtt < 1:1089269/90‑1 (MQ=255) tatCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCtt < 2:1693901/90‑1 (MQ=255) ggTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTtcgtc < 1:1652179/90‑1 (MQ=255) tCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGa < 2:967316/90‑1 (MQ=255) cGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGat < 1:484334/90‑1 (MQ=255) gTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTAGGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGAAATGACTGATAGCCCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGCCGata > 2:282791/1‑90 (MQ=255) gTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTaa < 2:868158/48‑1 (MQ=255) gTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTaa > 1:868158/1‑48 (MQ=255) gTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGata > 1:695/1‑90 (MQ=255) tGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATc > 1:2176100/1‑90 (MQ=255) tGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATc > 1:1803117/1‑90 (MQ=255) gCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCaaa < 1:1177567/90‑1 (MQ=255) gCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCaaa < 1:630682/90‑1 (MQ=255) gCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCaaa < 1:1297721/90‑1 (MQ=255) gCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCaaa < 2:1866638/90‑1 (MQ=255) cGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCtt < 2:1828204/75‑1 (MQ=255) cGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCtt > 1:1828204/1‑75 (MQ=255) cGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACg > 2:1111110/1‑90 (MQ=255) cGTTAAACTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACg > 1:1727515/1‑90 (MQ=255) ttAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACGGt > 1:642854/1‑90 (MQ=255) ttAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACGGt < 1:471181/90‑1 (MQ=255) aCATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACGGTTTGGGCAGa > 1:1891241/1‑90 (MQ=255) aCATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACGGTTTGGGCAGa > 1:1188594/1‑90 (MQ=255) ttACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACGGTTTGGGCAGATaa < 1:1391576/90‑1 (MQ=255) ttACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACGGTTTGGGCAGATaa < 1:203205/90‑1 (MQ=255) ttACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACGGTTTGGGCAGATaa > 2:255527/1‑90 (MQ=255) ttACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACGGTTTGGGCAGATaa > 2:2215512/1‑90 (MQ=255) aCGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACGGTTTGGGCAGATAATc > 2:977279/1‑90 (MQ=255) gcgGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACGGTTTGGGCAGATAATCaa < 1:1167944/90‑1 (MQ=255) | CGAAAGCCGACCGATAATACGGAACACGTCCTGCATGGCTGGCGCTTCGCCGATGATATCGGTCGTTGGGCCGTTAAGCTGAACATTACGCGGCTGCTGCTGTTCCTGGTAATGACTGATAGCGCGCTCAACCAGCGCCACTGCTTCGTCGATATCAAACGGTTTGGGCAGATAATCAA > NZ_CP009273/4048165‑4048343 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |