Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	578807	578823	17	2 [1]	[1] 2	BW25113_RS26085/appY	tail fiber assembly protein/DNA‑binding transcriptional activator AppY

TCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTTACTGTTGTTGAATGTGACT  >  NZ_CP009273/578717‑578810                                                                                          |     tCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTTACTGTTGTTGAAtgt      >  2:7611/1‑90 (MQ=255)     ttAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTTACTGTTGTTGAATGTGACt  <  2:123279/90‑1 (MQ=255)                                                                                          |     TCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTTACTGTTGTTGAATGTGACT  >  NZ_CP009273/578717‑578810

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑