Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	1540365	1540404	40	3 [2]	[2] 3	yddL/yddG	porin/aromatic amino acid efflux DMT transporter YddG

TAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAA  >  NZ_CP009273/1540277‑1540371                                                                                        |        tAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTgct       >  1:17227/1‑88 (MQ=255)      tCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTaa  >  2:348794/1‑90 (MQ=255)      tCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTaa  >  2:664185/1‑90 (MQ=255)                                                                                        |        TAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAA  >  NZ_CP009273/1540277‑1540371

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑