| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 1,196,737 | (C)5→4 | coding (100/312 nt) | BW25113_RS25530 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 1,196,733 | 0 | C | . | 100.0% | 65.7 / NA | 17 | coding (104/312 nt) | BW25113_RS25530 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (8/9); total (8/9) | |||||||||||
GTTTTGTAAAAAGGGCGGTACCAGAAAGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTGCCCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACCCGCG > NZ_CP009273/1196644‑1196814 | gTTTTGTAAAAAGGGCGGTACCAGAAAGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTGc < 1:799337/90‑1 (MQ=255)gTTTTGTAAAAAGGGCGGTACCAGAAAGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTGc > 2:310309/1‑90 (MQ=255) ttttGTAAAAAGGGCGGTACCAGAAAGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTGcc > 2:440546/1‑90 (MQ=255) gTAAAAAGGGCGGTACCAGAAAGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTGccccgg > 2:198217/1‑88 (MQ=255) gTAAAAAGGGCGGTACCAGAAAGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGCGGTGTCGGGTGccccgg > 2:369371/1‑88 (MQ=255) aaGGGCGGTACCAGAAAGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCt > 1:635597/1‑90 (MQ=255) aCCAGAAAGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGt < 1:445226/90‑1 (MQ=255) aaaGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGcac < 2:635597/90‑1 (MQ=255) aaaaaCTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTACACACCAGGCgggtgg > 2:850002/1‑90 (MQ=255) ggTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGGATccc > 2:244760/1‑89 (MQ=255) ggTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGGATCca > 2:522381/1‑90 (MQ=255) tcccGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCcaca < 2:597821/88‑1 (MQ=255) acacacAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAg < 2:194916/48‑1 (MQ=39) acacacAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAg > 1:194916/1‑48 (MQ=39) aGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCt > 1:488258/1‑90 (MQ=255) gCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTc < 2:633036/90‑1 (MQ=255) gCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTc < 2:763517/90‑1 (MQ=255) gCATAAAGTTGTGGTGTCGGCTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTc < 1:832181/90‑1 (MQ=255) gtggtgTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCgggt < 2:330599/49‑1 (MQ=255) gtggtgTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCgggt > 1:330599/1‑49 (MQ=255) gtggtgTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAAcc > 2:411582/1‑90 (MQ=255) tgtCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACCcgcg < 1:29592/90‑1 (MQ=255) | GTTTTGTAAAAAGGGCGGTACCAGAAAGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTGCCCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACCCGCG > NZ_CP009273/1196644‑1196814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |