Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 322,687 | A→G | I91T (ATC→ACC) | betA ← | choline dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 322,687 | 0 | A | G | 100.0% | 75.6 / NA | 22 | I91T (ATC→ACC) | betA | choline dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (9/13); total (9/13) |
TCGAGGTAGCTCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCAT > NZ_CP009273/322600‑322768 | tCGAGGTAGCTCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTc > 1:637181/1‑90 (MQ=255) tCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATc < 1:742557/90‑1 (MQ=255) ttCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCAccc < 2:62769/90‑1 (MQ=255) ctcCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAg < 2:464867/90‑1 (MQ=255) gACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCtt > 1:508071/1‑90 (MQ=255) ggTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCa < 2:663606/79‑1 (MQ=255) ggTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCa > 1:663606/1‑79 (MQ=255) gcCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCAc < 2:131130/90‑1 (MQ=255) ccAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTc < 1:373928/90‑1 (MQ=255) aTCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGtt < 2:72108/90‑1 (MQ=255) aTCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGtt < 1:633680/90‑1 (MQ=255) tCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTa > 1:434161/1‑90 (MQ=255) gcgcATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCa > 2:367952/1‑90 (MQ=255) tGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACg < 1:276114/90‑1 (MQ=255) aTGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGt < 2:150391/90‑1 (MQ=255) aTGTAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGt < 2:397306/90‑1 (MQ=255) tAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGt > 2:357359/1‑67 (MQ=255) tAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGt < 1:357359/67‑1 (MQ=255) tAGCACATGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTcc < 1:212761/90‑1 (MQ=255) caTGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGGTCAGGGTCCCTTTc > 1:118646/1‑90 (MQ=255) aTGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACTGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCa > 2:666602/1‑90 (MQ=255) tGCCGTTGGTCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCCGGTTCCGGTTCAt > 2:471558/1‑90 (MQ=255) | TCGAGGTAGCTCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCAT > NZ_CP009273/322600‑322768 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |