| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 1,659,576 | T→C | F14S (TTC→TCC) | clcB → | voltage‑gated ClC‑type chloride channel ClcB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 1,659,576 | 0 | T | C | 100.0% | 70.5 / NA | 21 | F14S (TTC→TCC) | clcB | voltage‑gated ClC‑type chloride channel ClcB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (12/9); total (12/9) | |||||||||||
TTTTGCCGCAAAATAGTCGCCCGTGTTTCATTGCCCATTTCTGCTCATGCATCATCTACACATCTATCCGGATCTGCGCACTATGTTCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGATGCTGCTACTGGAG > NZ_CP009273/1659490‑1659661 | ttttGCCGCAAAATAGTCGCCCGTGTTTCATTGCCCATTTCTGCTCATGCATCATCTACACATCTATCCGGATCTGCGCACTATGTCCCa < 2:590221/90‑1 (MQ=255) gCCCGTGTTTCATTGCCCATTTCTGCTCATGCATCATCTACACATCTATCCGGATCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAAc < 2:445774/90‑1 (MQ=255) tttCATTGCCCATTTCTGCTCATGCATCATCTACACATCTATCCGGATCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAgtcgtc < 2:707683/90‑1 (MQ=255) gCCCATTTCTGCTCATGCATCATCTACACATCTATCCGGATCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATtc > 2:94778/1‑90 (MQ=255) tGCATCATCTACACATCTATCCGGATCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTttgccg > 1:18951/1‑90 (MQ=255) tGCATCATCTACACATCTATCCGGATCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTttgccg > 1:768765/1‑90 (MQ=255) tGCATCATCTACACATCTATCCGGATCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTttgccg > 1:326745/1‑90 (MQ=255) catcTACACATCTATCCGGATCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTttgccgttgcc > 2:693976/1‑90 (MQ=255) acacATCTATCCGGATCTGCGCGCTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTTTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGtt > 1:17564/1‑90 (MQ=255) aTCTATCCGGATCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGt < 1:540262/90‑1 (MQ=255) aTCCGGATCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATg > 1:759644/1‑90 (MQ=255) ggATCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGAt < 2:432262/90‑1 (MQ=255) gATCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGAtg < 2:268450/90‑1 (MQ=255) gATCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGAtg < 2:380846/90‑1 (MQ=255) tCTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGAtgtt < 1:683581/90‑3 (MQ=255) cTGCGCACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGAtgctg > 2:437109/1‑90 (MQ=255) gcgcACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGGGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGATgctgct > 1:224790/1‑90 (MQ=255) gcgcACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGATgctgct > 1:380470/1‑90 (MQ=255) gcgcACTATGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGATgctgct > 1:750769/1‑90 (MQ=255) aTGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGATGCTGCTACTGGAg < 1:342028/90‑1 (MQ=255) aTGTCCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGATGCTGCTACTGGAg > 1:198739/1‑90 (MQ=255) | TTTTGCCGCAAAATAGTCGCCCGTGTTTCATTGCCCATTTCTGCTCATGCATCATCTACACATCTATCCGGATCTGCGCACTATGTTCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGATGCTGCTACTGGAG > NZ_CP009273/1659490‑1659661 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |