Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 1,524,815 | T→C | intergenic (‑54/‑28) | BW25113_RS25600 ← / → BW25113_RS07655 | protein YncO/ISAs1 family transposase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 1,524,815 | 0 | T | C | 100.0% | 42.7 / NA | 14 | intergenic (‑54/‑28) | BW25113_RS25600/BW25113_RS07655 | protein YncO/ISAs1 family transposase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (5/9); total (5/9) |
GGGCAAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAATAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTGACCCC > NZ_CP009273/1524729‑1524883 | gggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGaacaac > 1:666178/1‑90 (MQ=255) gggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGGGATCAAAATTTAACCTTTGGaacaac > 2:462705/1‑90 (MQ=255) aGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTaaaa > 2:740022/1‑90 (MQ=255) tCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGa < 2:585323/90‑1 (MQ=255) aTGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATa > 2:672313/1‑90 (MQ=255) ttGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAgg > 1:702427/1‑90 (MQ=255) ttGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAgg < 2:205815/90‑1 (MQ=255) tGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCtt < 1:750991/90‑1 (MQ=255) tGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCtt < 2:536301/90‑1 (MQ=255) gCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTg < 2:642437/90‑1 (MQ=255) gCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTg < 2:702427/90‑1 (MQ=255) tACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCa > 2:365210/1‑90 (MQ=255) aGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTg < 2:59680/90‑1 (MQ=255) ggTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTGa < 1:365210/90‑1 (MQ=255) gATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTGAccc > 2:113597/1‑90 (MQ=255) aTCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTGAcccc < 1:740022/90‑1 (MQ=255) | GGGCAAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAATAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTGACCCC > NZ_CP009273/1524729‑1524883 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |