| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | = 4609809 | 43 (1.260) | 3 (0.090) | 3/158 | 2.7 | 6.9% | coding (390/1224 nt) | deoB | phosphopentomutase |
| ? | NZ_CP009273 | 4609882 = | 41 (1.290) | coding (463/1224 nt) | deoB | phosphopentomutase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGTCACTGGGAAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGGTACGGTCATTCTGGATCAACTGGGCGAAGAGC > NZ_CP009273/4609720‑4609897 | ggTCACTGGGAAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGAT < 1:919487‑M1/90‑1 (MQ=255) tCACTGGGAAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATaa > 1:942030/1‑90 (MQ=255) tCACTGGGAAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATaa > 1:771808/1‑90 (MQ=255) cTGGGAAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACt > 2:662129/1‑90 (MQ=255) cTGGGAAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACt > 1:864687/1‑90 (MQ=255) aaaTTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCg > 1:257480/1‑90 (MQ=255) aTTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGaa < 2:231135/90‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAAc < 2:743367/90‑1 (MQ=255) gCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAAcgc < 1:260837/90‑1 (MQ=255) gCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAAcgc > 1:262109/1‑90 (MQ=255) cccGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCt > 1:212820/1‑90 (MQ=255) cGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGc < 1:339919/90‑1 (MQ=255) cGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGc < 2:178507/90‑1 (MQ=255) cTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGTTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGt < 2:127564/90‑1 (MQ=255) cTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGt < 1:746492/90‑1 (MQ=255) tGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATcaactgggcgaagagcacatgaaaaccggca > 1:916405‑M1/1‑59 (MQ=255) tGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAAcgc < 2:562453/74‑1 (MQ=255) tGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAAcgc > 1:562453/1‑74 (MQ=255) ggggATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTa < 2:927565/90‑1 (MQ=255) ggATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGTGTTACCTCGGTAAc > 2:626738/1‑90 (MQ=255) ggATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAAc > 1:670203/1‑90 (MQ=255) gATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACt < 2:951772/90‑1 (MQ=255) atTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGcc > 1:318599/1‑90 (MQ=255) atTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGcc < 2:86485/90‑1 (MQ=255) atTTCTCCAATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGcc > 2:136709/1‑90 (MQ=255) tttCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCa > 1:467531/1‑90 (MQ=255) ttCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCAc < 2:937267/90‑1 (MQ=255) ttCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCAc < 2:262109/90‑1 (MQ=255) ctcCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCActc > 1:715803/1‑90 (MQ=255) ccGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCtt < 2:917353/90‑1 (MQ=255) cGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTc < 2:624358/90‑1 (MQ=255) gATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTcc > 2:471254/1‑90 (MQ=255) cACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGGt < 2:676734/90‑1 (MQ=255) aGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTCCCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGGTACGGTCAtt < 1:958592/90‑1 (MQ=255) aGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGGTACGGTCAtt < 2:151438/90‑1 (MQ=255) aGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGGTACGGTCAtt < 1:865224/90‑1 (MQ=255) gCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGt < 2:885344/53‑1 (MQ=255) gCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGt > 1:885344/1‑53 (MQ=255) ttCCCGCAAGAGCTGCTGGATcaactgggcgaagagcacatgaaaaccggcaagccgat > 2:328536‑M1/1‑21 (MQ=255) ttCCCGCAAGAGCTGCTGGATcaactgggcgaagagcacatgaaaaccggcaagccgat < 1:328536‑M1/59‑39 (MQ=255) ttCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGtt > 2:527480/1‑52 (MQ=255) ttCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGtt < 1:527480/52‑1 (MQ=255) cccGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGGTACGGTCATTCTGGa < 2:90121/90‑1 (MQ=255) cAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGGTACGGTCATTCTGGATCaa > 2:790085/1‑90 (MQ=255) ggATcaactgggcgaagagcacatgaaaaccggcaagccgattttctatacctccgctgactccgtgttccagattgcctgccatgaaga > 2:745961‑M1/1‑4 (MQ=255) aTAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGGTACGGTCATTCTGGATCAACTGGGCGAAGAGc < 2:393605/90‑1 (MQ=255) aTAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGGTACGGTCATTCTGGATCAACTGGGCGAAGAGc < 1:328932/90‑1 (MQ=255) aTAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGGTACGGTCATTCTGGATCAACTGGGCGAAGAGc < 2:159488/90‑1 (MQ=255) | GGTCACTGGGAAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGGTACGGTCATTCTGGATCAACTGGGCGAAGAGC > NZ_CP009273/4609720‑4609897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |