| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 221,335 | T→C | noncoding (1078/1542 nt) | BW25113_RS01010 → | 16S ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 221,335 | 0 | T | C | 100.0% | 57.2 / NA | 21 | noncoding (1078/1542 nt) | BW25113_RS01010 | 16S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (12/9); total (12/9) | |||||||||||
TTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGC > NZ_CP009273/221248‑221418 | ttGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGa < 2:343214/90‑1 (MQ=255)ttGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGa < 2:127240/90‑1 (MQ=255) tGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGaa > 1:113823/1‑90 (MQ=255) tGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGaa > 1:217651/1‑90 (MQ=255) gACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGaaa < 1:506195/90‑1 (MQ=255) tCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGtt > 2:415336/1‑90 (MQ=255) ccACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGTTg > 2:112148/1‑90 (MQ=255) ttCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTcc > 2:375721/1‑90 (MQ=255) gaTGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACg < 2:493059/90‑1 (MQ=255) aTTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAgcgc < 2:591188/90‑1 (MQ=255) aTTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAgcgc < 2:173827/90‑1 (MQ=255) cTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTa < 1:131028/90‑1 (MQ=18) ttCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTAt > 2:388735/1‑90 (MQ=25) gtgAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGc > 2:611782/1‑90 (MQ=18) gagaCAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCa > 2:653376/1‑90 (MQ=18) aTGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCggg < 1:205099/90‑1 (MQ=25) ggCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGaa > 1:336879/1‑90 (MQ=18) gCTGTCGTCAGCTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAAc > 1:303977/1‑90 (MQ=18) gCTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGgaga > 1:443987/1‑90 (MQ=18) cTCGTGTTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGAc < 1:154317/90‑1 (MQ=18) gtgtTGCGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGc > 1:577752/1‑90 (MQ=18) | TTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGC > NZ_CP009273/221248‑221418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |