| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 4,385,675 | T→G | F92V (TTT→GTT) | tsaE → | tRNA (adenosine(37)‑N6)‑threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 4,385,675 | 0 | T | G | 100.0% | 76.0 / NA | 22 | F92V (TTT→GTT) | tsaE | tRNA (adenosine(37)‑N6)‑threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (11/11); total (11/11) | |||||||||||
CTGGTCGAACCCTATACGCTCGACAACTTAATGGTCTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGTTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCG > NZ_CP009273/4385594‑4385761 | cTGGTCGAACCCTATACGCTCGACAACTTAATGGTCTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATgggg > 1:331076/1‑90 (MQ=255) ggTCGAACCCTATACGCTCGACAACTTAATGGTCTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGAt > 1:101351/1‑90 (MQ=255) ggTCGAACCCTATACGCTCGACAACTTAATGGTCTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGAt > 1:146650/1‑90 (MQ=255) ggTCGAACCCTATACGCTCGACAACTTAATGGTCTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGAt > 2:358318/1‑90 (MQ=255) ggTCGAACCCTATACGCTCGACAACTTAATGGTCTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGAt > 1:329300/1‑90 (MQ=255) aCTTAATGGTCTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATg < 2:101351/90‑1 (MQ=255) ggTCTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTg < 1:168765/90‑1 (MQ=255) cTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCt < 1:52384/90‑1 (MQ=255) cTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCt > 1:70309/1‑90 (MQ=255) ttGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTg > 1:210292/1‑79 (MQ=255) ttGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTg < 2:210292/79‑1 (MQ=255) tttGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGcc < 1:117661/90‑1 (MQ=255) tttGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGcc < 2:279334/90‑1 (MQ=255) tACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCacaa > 1:210379/1‑90 (MQ=255) cTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAAAAAAGCCACCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGt > 2:74102/1‑90 (MQ=255) tGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTAc < 2:70309/90‑1 (MQ=255) tCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAg < 2:274243/67‑1 (MQ=255) tCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAg > 1:274243/1‑67 (MQ=255) tCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGgtgt > 2:249683/1‑90 (MQ=255) tCCCGAGGAGCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGgtgt < 2:62301/90‑1 (MQ=255) agCTGGAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTg < 2:74064/90‑1 (MQ=255) gAGGTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCg < 2:21623/90‑1 (MQ=255) | CTGGTCGAACCCTATACGCTCGACAACTTAATGGTCTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGTTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCG > NZ_CP009273/4385594‑4385761 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |