Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 3,576,634 | A→G | R79R (CGA→CGG) | BW25113_RS17825 → | YrhA family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 3,576,634 | 0 | A | G | 100.0% | 35.0 / NA | 12 | R79R (CGA→CGG) | BW25113_RS17825 | YrhA family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (6/6); total (6/6) |
GAAGTTAGTATTCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGATTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTCAGTTAAAAACCTTTTTGCCGTAAATGAATTTTATAGAAATAATGATGA > NZ_CP009273/3576551‑3576711 | gAAGTTAGTATTCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGGTTAttt > 2:431656/1‑90 (MQ=255) ttAGTATTCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGGTTATTTAGcc < 1:16284/90‑1 (MQ=255) ttAGTATTCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGGTTATTTAGcc < 2:308896/90‑1 (MQ=255) tAGTATTCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGGTTATTTAGCct > 1:303823/1‑90 (MQ=255) tAGTATTCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGGTTATTTAGCct > 2:452506/1‑90 (MQ=255) tCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGGTTATTTAGCCTCTCGAt < 1:70237/90‑1 (MQ=255) tttttAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGGTTATTTAGCCTCTCGATTc > 1:55433/1‑90 (MQ=255) tCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGGTTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTc < 1:474085/90‑1 (MQ=255) gagCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGGTTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTCAGTTAAAAACCTTTTTGCCGTAAATg < 2:303823/90‑1 (MQ=255) gAAGTTAATGGATTACGGTTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTCAGTTAAAAACCTTTTTGCCGTAAATGAATTTTATAGAaataat > 1:133294/1‑90 (MQ=255) gAAGTTAATGGATTACGGTTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTCAGTTAAAAACCTTTTTGCCGTAAATGAATTTTATAGAaataat > 2:508850/1‑90 (MQ=255) tAATGGATTACGGTTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTCAGTTAAAAACCTTTTTGCCGTAAATGAATTTTATAGAAATAAtgatga < 2:147262/90‑1 (MQ=255) | GAAGTTAGTATTCTTTTTAAGAATCAACCTGATTATCTTACTTTTTTAAGAGCAATGGATGGATTCGAAGTTAATGGATTACGATTATTTAGCCTCTCGATTCCAGAACCTTCAGTTAAAAACCTTTTTGCCGTAAATGAATTTTATAGAAATAATGATGA > NZ_CP009273/3576551‑3576711 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |