Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	1331755	1331776	22	2 [0]	[1] 2	acnA	aconitate hydratase AcnA

CGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTAAAACTAACTGGCTGGCCTCGCCGCCGCTGGTGGT  >  NZ_CP009273/1331665‑1331754                                                                                          | cggtgcggtgCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTAAAACTAACTGGCTGGCCTCGCCGCCGCTggtggt  <  1:333314/90‑1 (MQ=255) cggtgcggtgCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTAAAACTAACTGGCTGGCCTCGCCGCCGCTggtggt  >  2:617773/1‑90 (MQ=255)                                                                                          | CGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTAAAACTAACTGGCTGGCCTCGCCGCCGCTGGTGGT  >  NZ_CP009273/1331665‑1331754

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑