| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 2,955,978 | T→G | Q49P (CAG→CCG) | ppdC ← | prepilin‑type N‑terminal cleavage/methylation domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 2,955,978 | 0 | T | G | 100.0% | 58.7 / NA | 19 | Q49P (CAG→CCG) | ppdC | prepilin‑type N‑terminal cleavage/methylation domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (7/12); total (7/12) | |||||||||||
GCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCATTAATGTTCGCTGGAAACCCGATAACGCAGTGACAATCATCA > NZ_CP009273/2955892‑2956053 | gCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGtt < 1:327380/90‑1 (MQ=255)gCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGtt > 2:218349/1‑90 (MQ=255) cTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTg > 2:451850/1‑90 (MQ=255) cATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGtt > 2:519402/1‑90 (MQ=255) cGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTctg < 1:519402/90‑1 (MQ=255) cGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTctg < 2:442997/90‑1 (MQ=255) cGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTctg < 2:358514/90‑1 (MQ=255) ggTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTctgc > 1:99173/1‑90 (MQ=255) cTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAg < 2:16493/90‑1 (MQ=255) gCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGAc < 2:548032/90‑1 (MQ=255) gCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGAc < 2:278083/90‑1 (MQ=255) gCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTCTACTGGCAAGAc > 2:501747/1‑90 (MQ=255) tGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGAACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCa > 2:373514/1‑90 (MQ=255) cgcgcgCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCATTAATGTTCGCTGGaa < 2:25604/90‑1 (MQ=255) gTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCATTAATGTTCGCTGGAAACCCGATa < 2:364466/90‑1 (MQ=255) gctgcCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCATTAATGTTCGCTGGAAACCCGATAACGCAGTGa < 2:135410/90‑1 (MQ=255) ctgcCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCATTAATGTTCGCTGGAAACCCGATa > 2:522263/1‑80 (MQ=255) ctgcCAGCCATGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCATTAATGTTCGCTGGAAACCCGATa < 1:522263/80‑1 (MQ=255) caTGCCGCCAGAGCGGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCATTAATGTTCGCTGGAAACCCGATAACGCAGTGACAAtcatca < 2:159934/90‑1 (MQ=255) | GCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCATTAATGTTCGCTGGAAACCCGATAACGCAGTGACAATCATCA > NZ_CP009273/2955892‑2956053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |