| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 1,524,815 | T→C | intergenic (‑54/‑28) | BW25113_RS25600 ← / → BW25113_RS07655 | protein YncO/ISAs1 family transposase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 1,524,815 | 0 | T | C | 100.0% | 52.3 / NA | 17 | intergenic (‑54/‑28) | BW25113_RS25600/BW25113_RS07655 | protein YncO/ISAs1 family transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (10/7); total (10/7) | |||||||||||
GGGCAAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAATAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTGACCCCTGATATACGACAACA > NZ_CP009273/1524729‑1524898 | gggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGaacaac > 2:493699/1‑90 (MQ=255) aGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTaaaa < 1:11517/90‑1 (MQ=255) aGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTaaaa > 1:625111/1‑90 (MQ=255) aGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGGGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTaaaa > 2:478311/1‑90 (MQ=255) aTGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATa > 2:681184/1‑90 (MQ=255) gTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAgg < 2:523211/83‑1 (MQ=255) gTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAgg > 1:523211/1‑83 (MQ=255) cGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTAt > 2:477891/1‑90 (MQ=255) cTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTg > 2:450896/1‑90 (MQ=255) gCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTg < 1:193939/90‑1 (MQ=255) tttAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGAt < 2:1889/90‑1 (MQ=255) cTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTc > 1:590583/1‑90 (MQ=255) cTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTc > 1:501749/1‑90 (MQ=255) tGATCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTGAcc < 1:5022/90‑1 (MQ=255) tCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTGACCCCt > 1:659743/1‑90 (MQ=255) tCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTGACCCCt < 2:659743/90‑1 (MQ=255) tCAAAATTTAACCTTTGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTGACCCCt < 1:276905/90‑1 (MQ=255) ttGGAACAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTGACCCCTGATATACGacaaca > 1:54781/1‑90 (MQ=255) | GGGCAAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTTAACGCCTACAGGTGATCAAAATTTAACCTTTGGAATAACTAAAAAGATAAAAAAGGACGCCAGGTGAGTATTCAAAGTTTGCTTGATTATATTTCAGTGACCCCTGATATACGACAACA > NZ_CP009273/1524729‑1524898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |