| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 2,359,692 | A→C | T96P (ACG→CCG) | arnB → | UDP‑4‑amino‑4‑deoxy‑L‑arabinose aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 2,359,692 | 0 | A | C | 100.0% | 49.5 / NA | 17 | T96P (ACG→CCG) | arnB | UDP‑4‑amino‑4‑deoxy‑L‑arabinose aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (11/6); total (11/6) | |||||||||||
GTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAG > NZ_CP009273/2359607‑2359776 | gTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCACCGcc > 1:82222/1‑90 (MQ=255) gAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGt > 1:215456/1‑90 (MQ=255) gAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGt > 1:316329/1‑90 (MQ=255) aaaTTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGTaa < 2:214240/90‑1 (MQ=255) cAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCGGGGTTTCACCCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGTAATGGTGGa < 2:351672/90‑1 (MQ=255) gATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGAc < 1:303520/90‑1 (MQ=255) cccTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCa < 1:313292/90‑1 (MQ=255) ctCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTAt < 1:99165/89‑1 (MQ=255) ccTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTc > 2:326283/1‑90 (MQ=255) aTTTCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACg > 1:182289/1‑90 (MQ=255) aTTTCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACg > 1:259485/1‑90 (MQ=255) tCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCa > 2:391640/1‑90 (MQ=255) tCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCa > 1:366265/1‑90 (MQ=255) tCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACACCa > 1:73231/1‑90 (MQ=255) tgGGTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTa > 1:279972/1‑90 (MQ=255) gTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAg > 2:316245/1‑90 (MQ=255) gTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAg < 1:169846/90‑1 (MQ=255) | GTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAG > NZ_CP009273/2359607‑2359776 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |