Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 3,901,121 | A→G | D202D (GAT→GAC) | pstB ← | phosphate ABC transporter ATP‑binding protein PstB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 3,901,121 | 0 | A | G | 100.0% | 52.6 / NA | 18 | D202D (GAT→GAC) | pstB | phosphate ABC transporter ATP‑binding protein PstB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (9/9); total (9/9) |
TCGCCCAGGTACATAAACGCCGTGTGGTCGGAACAACGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAATCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGCCCGGTAGAGATAGGGTCGAGCGCCGAACACGGTTC > NZ_CP009273/3901041‑3901192 | tCGCCCAGGTACATAAACGCCGTGTGGTCGGAACAACGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTc < 1:357255/90‑1 (MQ=255) gCCCAGGTACATAAACGCCGTGTGGTCGGAACAACGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAg < 1:369886/90‑1 (MQ=255) ggTACATAAACGCCGTGTGGTCGGAACAACGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCgg > 2:284090/1‑90 (MQ=255) gtgtGGTCGGAACAACGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCa > 2:215550/1‑90 (MQ=255) gtgtGGTCGGAACAACGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGAAGCCCTGCTTCAGTTCGGGGATCAGCTCTTCa > 1:93763/1‑90 (MQ=255) cGGAACAACGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGcc > 2:37653/1‑90 (MQ=255) ggAACAACGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGccc < 2:25495/90‑1 (MQ=255) gAACAACGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCCCCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGCCCg < 2:305751/90‑1 (MQ=255) aacaacGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGCCCgg > 1:363832/1‑90 (MQ=255) aacaacGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGCCCgg > 1:51103/1‑90 (MQ=255) caacGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGCCCGGTa < 2:100245/90‑1 (MQ=255) caacGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGCCCGGTa < 2:327971/90‑1 (MQ=255) ccgcgCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGCCCGGTa > 2:374775/2‑88 (MQ=255) ccgcgCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGCCCGGTa < 1:374775/87‑1 (MQ=255) gcATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGCCCGGTAGAGATAGGGTCGAgcg < 2:363832/90‑1 (MQ=255) gACGATCACCACGGTGTAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGCCCGGTAGAGATAGGGTCGAGCGCCGAACACGGTtc > 1:79763/1‑90 (MQ=255) gtgtAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGcc < 1:53623/43‑1 (MQ=255) gtgtAGTCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGcc > 2:53623/1‑43 (MQ=255) | TCGCCCAGGTACATAAACGCCGTGTGGTCGGAACAACGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAATCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGCCCGGTAGAGATAGGGTCGAGCGCCGAACACGGTTC > NZ_CP009273/3901041‑3901192 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |