Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 4,034,572 | T→G | Q74H (CAA→CAC) | mobB ← | molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 4,034,572 | 0 | T | G | 100.0% | 76.0 / NA | 25 | Q74H (CAA→CAC) | mobB | molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (14/11); total (14/11) |
CAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCAT > NZ_CP009273/4034488‑4034657 | cAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTgctg > 1:398361/1‑90 (MQ=255) gAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCa < 2:389167/90‑1 (MQ=255) tATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGa < 2:284293/90‑1 (MQ=255) aTCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGAt > 2:375547/1‑90 (MQ=255) aTCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGAt > 1:101620/1‑90 (MQ=255) ttCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGttt > 1:15057/1‑90 (MQ=255) ttCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGttt > 1:404932/1‑90 (MQ=255) tGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCcgc > 2:295033/1‑90 (MQ=255) aGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTgcgc < 1:103164/90‑1 (MQ=255) aGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTgcgc < 1:423458/90‑1 (MQ=255) aGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCa > 1:18622/1‑90 (MQ=255) cttcttCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGc < 2:385949/90‑1 (MQ=255) cttcttCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGc < 2:233878/90‑1 (MQ=255) tcttcGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGc < 1:411439/62‑1 (MQ=255) tcttcGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGc > 2:411439/1‑62 (MQ=255) tcttcGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTa > 1:364633/1‑90 (MQ=255) gTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCttt > 2:297728/1‑90 (MQ=255) tGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGcc > 1:302642/1‑90 (MQ=255) gtgtTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTg > 1:151203/1‑90 (MQ=255) tttCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCt < 1:173115/90‑1 (MQ=255) caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 2:104998/90‑1 (MQ=255) caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 2:92322/90‑1 (MQ=255) aGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCa > 1:65885/1‑90 (MQ=255) cATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCa > 1:182189/1‑90 (MQ=255) aTCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCAt < 1:213456/90‑1 (MQ=255) | CAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCAT > NZ_CP009273/4034488‑4034657 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |