Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 70,289 | G→T | intergenic (‑241/‑98) | araB ← / → araC | L‑ribulokinase/DNA‑binding transcriptional dual regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 70,289 | 0 | G | T | 99.9% | 2645.1 / NA | 673 | intergenic (‑241/‑98) | araB/araC | L‑ribulokinase/DNA‑binding transcriptional dual regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (335/337); total (336/337) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 714 total aligned reads displayed.
TTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGAAAAGT > NC_000913/70191‑70386 | tttCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGt > 2:91973/1‑101 (MQ=255) ttCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGtt > 1:7068679/1‑101 (MQ=255) cTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGGTACCGGTTTGGTTAg > 1:13808637/1‑101 (MQ=255) tGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGTGGTTACCGGTTTGGTTAGc > 2:3724779/1‑101 (MQ=255) tGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGc < 2:246904/101‑1 (MQ=255) tGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGc < 2:4935272/101‑1 (MQ=255) tGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGc < 2:5061268/101‑1 (MQ=255) tGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGc > 1:2379598/1‑101 (MQ=255) ccGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCga > 1:7466135/1‑101 (MQ=255) nnnaTTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCgaga < 2:7434273/98‑1 (MQ=255) gTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCgnnn > 2:11345460/1‑98 (MQ=255) tGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGagaa > 2:7112862/1‑101 (MQ=255) aTTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGagaaga > 1:11883564/1‑101 (MQ=255) nnntaGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAagag < 2:13794296/98‑1 (MQ=255) tataGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTCGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGTTTACCGGTTTGGTTAGCGagaagnnn > 2:12678272/1‑98 (MQ=255) taGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCCTGGCGTTGGTGCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCa > 2:6081561/1‑101 (MQ=255) taGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCa > 1:13544850/1‑101 (MQ=255) taGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCa < 1:7755281/101‑1 (MQ=255) cacTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCAAGAAGAGCCAGaaa > 1:2687874/1‑101 (MQ=255) cTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTaaaa > 1:9046290/1‑101 (MQ=255) cTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTaaaa > 1:169963/1‑101 (MQ=255) ttttGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGATTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAg < 1:11995798/101‑1 (MQ=255) tttGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGa > 1:14847004/1‑101 (MQ=255) nnngTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTCCCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGa < 2:8313067/98‑1 (MQ=255) ttGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTaaaannn > 2:14840271/1‑98 (MQ=255) tcttACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTGCCAGTTTGGTTGGCGAGAAGAGCCAGTAAAAgnnn > 2:10593309/3‑98 (MQ=255) tGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGTTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACg > 1:6951631/1‑101 (MQ=255) tGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTAACCGGTTTGGTTAGAGAGTAGAGACAGTAAAAGACg > 1:3657790/1‑101 (MQ=255) tGTTACGAGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACg < 1:10086590/101‑1 (MQ=255) ttACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCa < 1:992213/101‑1 (MQ=255) tACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAg > 1:13994614/1‑101 (MQ=255) tACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAg < 2:6804497/101‑1 (MQ=255) aCGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGcnnn > 2:8577620/1‑98 (MQ=255) aCGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGt < 1:12453189/101‑1 (MQ=255) aCGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGt < 1:6026939/101‑1 (MQ=255) gcgTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAGGACGCAGTGa < 1:6480714/101‑1 (MQ=255) gcgTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGa > 1:632801/1‑101 (MQ=255) cgTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGAc > 1:10921612/1‑101 (MQ=255) cgTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGAc > 1:11132280/1‑101 (MQ=255) ttttGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGc < 2:585414/101‑1 (MQ=255) tttGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACgnnn > 2:12068627/1‑98 (MQ=255) tGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAAt > 2:2712682/1‑101 (MQ=255) cATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTc > 2:6208909/1‑101 (MQ=255) aTGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCt < 1:14566237/101‑1 (MQ=255) aTGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCt < 1:2860174/101‑1 (MQ=255) tGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTg < 1:9811230/101‑1 (MQ=255) ggCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGa < 2:6444032/101‑1 (MQ=255) gCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGAt > 1:11467441/1‑101 (MQ=255) nnntGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGAta < 2:11599451/98‑2 (MQ=255) cTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCCGTGACGGCAATGTCTGATg > 1:674890/1‑101 (MQ=255) tttGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGc < 1:2051144/101‑1 (MQ=255) tttGGTCCCGCTTAGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGannn > 2:14283070/1‑98 (MQ=255) ttGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCa < 1:5234293/101‑1 (MQ=255) tGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCaa > 1:13369958/1‑101 (MQ=255) tGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCaa > 1:13150701/1‑101 (MQ=255) ggTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAat > 2:786960/1‑101 (MQ=255) gTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGTCGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCannn > 2:12957264/1‑98 (MQ=255) cccGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATg > 1:4546156/1‑101 (MQ=255) nnncTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATgg < 2:13994614/98‑1 (MQ=255) cTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACa < 2:3273330/101‑1 (MQ=255) nnnaCAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTg < 2:12414655/98‑1 (MQ=255) ttACACAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTCGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTgg < 2:5461954/101‑1 (MQ=255) nnncAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTgg < 2:13580175/98‑1 (MQ=255) tcAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGTTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGtt < 2:4301749/100‑1 (MQ=255) cAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGttt > 2:1800088/1‑101 (MQ=255) aGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGtnnn > 2:9575457/1‑98 (MQ=255) gAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTttct > 1:5588552/1‑101 (MQ=255) agtGCTTTTAATAAGCGGGGTTGCCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTttctt < 2:2919556/99‑1 (MQ=255) aTGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTttcttc > 1:8507299/1‑101 (MQ=255) tGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTtcttct < 1:12190673/101‑1 (MQ=255) gCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTtctc < 2:6609535/101‑1 (MQ=255) gCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTtctc > 1:4415645/1‑101 (MQ=255) cTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTctct < 1:4041657/101‑1 (MQ=255) cTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTctct > 2:69494/1‑101 (MQ=255) tttAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGa < 1:9542005/101‑1 (MQ=255) nnnaaGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAAtg < 2:10305601/98‑1 (MQ=255) atacGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGTAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAAtgg > 1:10394753/1‑101 (MQ=255) ataaGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAAtgg < 2:3983899/101‑1 (MQ=255) aggCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAAtgnnn > 2:10891674/3‑98 (MQ=255) aaGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAAtgnnn > 2:9666721/1‑98 (MQ=255) aaGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAAtggtg > 1:4719310/1‑101 (MQ=255) aaGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGGAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAAtggtg > 1:11680587/1‑101 (MQ=255) gCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGACGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTggg < 1:8015497/101‑1 (MQ=255) gCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTggg < 1:8659701/101‑1 (MQ=255) gCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTggg > 2:1900954/1‑101 (MQ=255) cGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAAtggtgnnn > 2:9097161/1‑98 (MQ=255) cGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGa > 1:10707080/1‑101 (MQ=255) cGGGGTTACCGGTCTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGa < 1:2166636/101‑1 (MQ=255) nnnttACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGt < 2:7694248/98‑1 (MQ=255) gTTCCCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTAt < 2:4607728/101‑1 (MQ=255) gTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGCCGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTAt < 1:3251597/101‑1 (MQ=255) tACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGa > 1:8291714/1‑101 (MQ=255) tccGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGaa < 1:10548539/100‑1 (MQ=255) aCCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGaa < 1:4941611/101‑1 (MQ=255) ccGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGaaa < 1:12825179/101‑1 (MQ=255) ccGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGCTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGaaa < 1:14314126/101‑1 (MQ=255) cGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGaaaa < 1:9249712/101‑1 (MQ=255) ggTTTGGTTAGCGAGGAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCACTGTCTGAGGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGaannn > 2:14598529/1‑98 (MQ=255) gTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGAAAAga > 2:2259344/1‑100 (MQ=255) gTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGAAAAGt > 2:1342283/1‑101 (MQ=255) | TTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGAAAAGT > NC_000913/70191‑70386 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |