New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3497415 | 46 (0.720) | 9 (0.140) | 9/464 | 4.0 | 16.1% | coding (413/807 nt) | nirC | nitrite transporter NirC |
? | NC_000913 | 3497429 = | 48 (0.750) | coding (427/807 nt) | nirC | nitrite transporter NirC | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTCGGTAATTTGCTCGATCCATCCGTACGCCCTTTGGTGATGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACACGCTGGCGGGTATTGGTCATAACCTGCTGTGGGTG > NC_000913/3497144‑3497689 | cTCGGTAATTTGCTCGATCCATCCGTACGCCCTTTGGTGATGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCa < 1:370147/275‑1 (MQ=255) tAATTTGCTCGATCCATCCGTACGCCCTTTGGTGATGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTCGATACCAGCATCGTTCACTCCg > 2:447853/1‑275 (MQ=255) gCTCGATCCATCCGTACGCCCTTTGGTGATGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCgcgc < 1:572846/275‑1 (MQ=255) cGCCCTTTGGTGATGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTg > 2:625725/1‑274 (MQ=255) cTTTGGTGATGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGt < 2:84790/241‑1 (MQ=255) tttGGTGATGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCAcc > 2:236969/1‑273 (MQ=255) cgcgACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTActct > 1:657849/1‑275 (MQ=255) cgcgACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTg < 1:640773/274‑1 (MQ=255) cgACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCAACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACTAGCATCGTTCACTCCGTCGCTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAAAGGTCCtcttc > 1:410861/1‑275 (MQ=255) tnttGGTAGCGCCTTAACGCTGGTGCTTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCGTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTa < 2:410860/263‑1 (MQ=255) ggTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAAGGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTCGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCaa > 1:458708/1‑272 (MQ=255) ccTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATtg > 1:125985/1‑275 (MQ=255) aCGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTaa < 1:625727/275‑1 (MQ=255) tCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAAt < 2:125985/275‑1 (MQ=255) ttCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTgg > 2:148708/1‑193 (MQ=255) ccGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTaa < 1:148708/193‑1 (MQ=255) acacCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGGCTAAAACCACTGCACCGGCATTGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTCGCAATACGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGggcggc > 1:247678/1‑273 (MQ=255) gTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTAt > 1:240398/1‑275 (MQ=255) ttCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAgggg > 1:323232/1‑274 (MQ=255) tCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGggcggc > 2:358535/1‑274 (MQ=255) cACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGa < 1:291384/275‑1 (MQ=255) ttGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCTGATTGAAGGGGCGGCGCAAttt > 2:565948/1‑275 (MQ=255) tCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTctg < 2:323232/275‑1 (MQ=255) accGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGTTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTc < 2:247678/272‑1 (MQ=255) gggCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTc > 1:173538/1‑129 (MQ=255) aaaTGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCgcgc < 2:173538/129‑1 (MQ=255) gggCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACAGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTc < 2:657847/274‑1 (MQ=255) gCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCCTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGGCTAAGACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCActct < 2:240398/275‑1 (MQ=255) tCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTa > 2:271750/1‑274 (MQ=255) tGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAg < 1:236969/275‑1 (MQ=255) tCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTa > 2:477285/1‑244 (MQ=255) tCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCAGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGCCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCCGGTGGTGTCCGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTACCGCCAACATGCCGcctttc > 2:656199/1‑270 (MQ=255) tttCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCATCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTcgcg < 1:565949/274‑1 (MQ=255) gTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTTTATAGCTGGGGCGGCGGTTGCCTGGTGCCGTGAGATACCAGCATCGTTCGCTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTTGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGTGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTcgcg < 1:263773/275‑1 (MQ=255) ttCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAg < 1:477286/244‑1 (MQ=255) gCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTa > 1:282573/1‑275 (MQ=255) ggggCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTGTa > 2:126849/1‑222 (MQ=255) ggggCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGcc > 2:613556/1‑275 (MQ=255) gggCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCg > 2:195564/1‑73 (MQ=255) gggCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGTCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCCACCACCGCGACGCCt > 2:310986/1‑275 (MQ=255) gggCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCt > 1:21914/1‑275 (MQ=255) gcggcgGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGtt > 2:422091/1‑253 (MQ=255) cggcggTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTGTATCGc < 1:126849/222‑1 (MQ=255) ggcggTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCaa < 1:195564/73‑1 (MQ=255) cggTGGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGc < 1:422092/253‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACACGCTGGc < 2:21914/274‑1 (MQ=255) ctgcCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAACTTTATCGCCTTCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACCAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACACCCTGGCg > 1:649975/1‑270 (MQ=255) ggTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACACGCTGGCGGGTATTGGTc < 1:358535/275‑1 (MQ=255) aGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACACGCTGGCGGGTATTGGTCATAACctgct < 1:271750/275‑1 (MQ=255) cATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCAGGCTACGAGCCCTCTTTCGCTAACATGACGCTGTTTGCTCTCTCCTGGTTAGGCAACCACCGCGAAGCCTACACGCTGGCGGGTATTGGTCATAACCTGCtgt > 2:642166/1‑275 (MQ=255) ttCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTAt > 1:202283/1‑136 (MQ=255) ttCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATcgcg > 1:155238/1‑164 (MQ=255) ttCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGACTACACGCTGGCGGGTATTGGTCATAACNCGCTGTGGGTg > 2:407923/1‑275 (MQ=255) | CTCGGTAATTTGCTCGATCCATCCGTACGCCCTTTGGTGATGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACACGCTGGCGGGTATTGGTCATAACCTGCTGTGGGTG > NC_000913/3497144‑3497689 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |