New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1320853 | 41 (0.660) | 5 (0.080) +GGT |
4/444 | 5.6 | 10.8% | coding (532/1596 nt) | trpD | anthranilate synthase subunit TrpD |
? | NC_000913 | 1320854 = | 41 (0.640) | coding (531/1596 nt) | trpD | anthranilate synthase subunit TrpD | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGCGGGAACGGCGCTGCGTTTTCCAGTAGCGCGGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTACCGTGGAGAATTTCGCCCGCCTGACCGACATAGCCCCCGTAAGCTTCGACAAT > NC_000913/1320582‑1321117 | cgcgGGAACGGCGCTGCGTTTTCCAGTAGCGCGGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCCGCGCCTGAACCAGTTTTTCCAGAATCGGTTGGAGCGTGGTGGCTGGCCCTAGTTTTCTCTGCGCCCCGGCCAGCGGTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCGTG‑‑‑ggt > 2:99645/1‑275 (MQ=255) gCGTTTTCCAGTAGCGCGGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGCATggctgc > 2:487685/1‑271 (MQ=255) ttccgttAGCGCTGTTGCTTCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTTCTCACCGCGAATTTTGAAGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCGTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTGGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGa < 1:99645/268‑1 (MQ=255) ttCCAGTAGCGCTGTTGCTGACCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGCATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCGCCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGa < 2:523924/274‑1 (MQ=255) gTAGCGCGGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGaa < 2:512360/274‑1 (MQ=255) cgcgGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTCCTCACCGCGAAGTTTCATGCTCACCGTCGCCGCCGCCAGTTGTTTCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGa < 1:478928/275‑1 (MQ=255) ttGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGTGAGAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAAt > 2:595952/1‑274 (MQ=255) gCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTTGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCTGGATGGAACTGGAATCAACAAGCGCGac > 1:261009/1‑273 (MQ=255) tGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTa < 2:142372/274‑1 (MQ=255) cACCGCGAATTTTCATGCTCGCCCGCGCCGCCGCCAGTTTTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGcc < 2:261009/275‑1 (MQ=255) ccggcgcCGCCGCCAGTTGTGCCGGCTTCAGCTGGCCACGTACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCTCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGATGGCTCTAGTTTCTGCTGGGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGACCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATgg < 1:1090/272‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATg < 1:487686/274‑1 (MQ=255) ccgccAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGa > 2:282268/1‑236 (MQ=255) cAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTa < 1:282268/236‑1 (MQ=255) cGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGTGAGAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAAccggc < 1:595953/275‑1 (MQ=255) gCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGa < 1:138042/275‑1 (MQ=255) cTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGaa > 2:460014/1‑275 (MQ=255) cGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGGTACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACCGCCAACCAGCgcgg > 2:163440/1‑272 (MQ=255) aaCAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCATGATACAGTTTTTCAAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCAGCTGCGCCAAAGCCAGCGTATGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCAACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAAcg > 1:656273/1‑275 (MQ=255) gtggCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAAc > 2:231912/1‑230 (MQ=255) cTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAAccggc < 1:231912/230‑1 (MQ=255) tttCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTTGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAg < 1:460015/274‑1 (MQ=255) tAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGCGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGt > 1:388280/1‑271 (MQ=255) ggTCTGGNCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCATCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGGGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAAt < 2:388279/270‑1 (MQ=255) tCTGCGCCTGATACAGTTTTGCCTGAGTCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTTCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATGCCGGATGGACCTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCa < 2:656271/275‑1 (MQ=255) gaacgggttccAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCGGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGGCGTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCaaa < 1:142643/264‑1 (MQ=255) ttttCCGGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTc < 2:350566/275‑1 (MQ=255) ttCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCgg > 2:142643/1‑254 (MQ=255) tCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTGGGTGGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTc > 1:657668/1‑275 (MQ=255) ccAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGATTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCAt > 1:511263/1‑273 (MQ=255) aaTCGGTTGCTGCGTGTTGGCTTGCTCTAGGTTCTGCGGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTGGGTGGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGtt < 2:657666/275‑1 (MQ=255) aTCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGCTGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCa > 1:626623/1‑229 (MQ=255) aTCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCa < 2:626621/229‑1 (MQ=255) tgtTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTa > 1:104712/1‑275 (MQ=255) ttGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTAc > 1:387962/1‑274 (MQ=255) ctggctCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGCGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACCTCGCCTGAACGGCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTACCGTg > 2:544983/1‑274 (MQ=255) tgctgcGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTACCGTGGAGAATTTcgcccgc < 2:387961/275‑1 (MQ=255) gcgcCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTACCGTGGAGAATTTCGCCCGCCTGa < 2:104712/275‑1 (MQ=255) cgcCCAGGCCCGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCTATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTACCGTGGAGAATTTCGCCCGCCTGa < 1:570061/274‑1 (MQ=255) cgcCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAAc > 2:105539/1‑165 (MQ=255) cccAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTACCGTGGAGAATTTCGCCCGCCTGACCg > 1:136775/1‑275 (MQ=255) cAGGACAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGc < 1:105539/165‑1 (MQ=255) aGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGGCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGACACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTACCGTGGAGAATTTTGCCCGACTGACCGa > 1:288862/1‑273 (MQ=255) aGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTACCGTGGAGAATTTCGCCCGCCTGACCGACATAGcc > 1:464732/1‑275 (MQ=255) gCGTTGGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGAATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCCCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTTATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTTAAAACGCGCAACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTACCGTGGAGAATTTCGCCCGCCTGACCGACATAGcc < 1:385273/274‑1 (MQ=255) gAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTACCGTGGAGAATTTCGCCCGCCTGACCGACATAGCCCCCGTAAGCTTCGACAAt < 1:544984/274‑1 (MQ=255) | CGCGGGAACGGCGCTGCGTTTTCCAGTAGCGCGGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTTGGCTAAGCGTCTGCGCCTGATACAGTTTTTCCAGAATCGGTTGCAGCGTGTTGGCTGGCTCTAGTTTCTGCTGCGCCCAGGCCAGCGTTTGTTCCAGCAGGCGAGCGCCCTG‑‑‑GGTGGT‑‑GAGAATGGATTCCGGATGGAACTGGAATCCACAAACGCGATCCGCATCGTGACGTACTGCCATCACCATGCCATTAAAATGGGCGTTGATGGTTAAACCGGCCGGAATGTTACTGCCAACCAGCGAGTGATAACGCGCCACCGGCAGCGGGTTTGTTAATCCGGCAAACATCGCCTGACCGTCATGTTCAATGCTGGAGGCTTTACCGTGGAGAATTTCGCCCGCCTGACCGACATAGCCCCCGTAAGCTTCGACAAT > NC_000913/1320582‑1321117 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |