| New junction evidence | |||||||||||
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ctgGCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGA‑GGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGAc < 2:234565/157‑1 (MQ=255) ggCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGA‑GGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTAtg < 1:673030/289‑1 (MQ=255) gCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGA‑GGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTGGGACCGGGCCCGTGCATTGTATTGAGGGAGCTAATGATTATGATTCCGTTAtgg > 2:297431/1‑289 (MQ=255) 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ggCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGTTTATGTTGGCAAGTATTATCGCTACTCAt > 1:551714/1‑289 (MQ=255) aaaGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTg < 1:297431/289‑1 (MQ=255) aTTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaa < 1:159517/289‑1 (MQ=255) aTTTCGACGCGTACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGGCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTAGGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaa < 1:89874/289‑1 (MQ=255) cGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAgg < 1:180060/289‑1 (MQ=255) gacCTGGCATGTTCATTTTATTTATGTCA‑TCCCAGGGCGTGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTTCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGAGCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGt < 2:117682/289‑1 (MQ=255) agccTGGCAGGATGATTTTATTGATGTCA‑TCACAGGGCGTGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGt < 2:414597/287‑1 (MQ=255) acTGGCAGAATTATTTTATTGA‑GTGAGTCAAAGGGCTGGGGGAAGGTTTTGTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGGCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGTTCGTGTAGTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATAGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGTGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCa < 2:555714/288‑1 (MQ=255) gcagcaTCATTTTATTGATGTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTTGCGCCTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCCGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTGTTATCGCTACTCCTAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGGCGGATTACACCCGGGCAACATACGCAgggg > 2:187819/1‑289 (MQ=255) atgcggcagggcaaTGTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGt < 2:653768/266‑1 (MQ=255) atgcggcagggcaaTGTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGt > 1:653768/14‑279 (MQ=255) ttttATTGATGTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGCCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAcc > 2:1068644/1‑288 (MQ=255) gTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAt > 2:891255/1‑245 (MQ=255) gTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAt < 1:891255/245‑1 (MQ=255) ggcgggcgGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgc < 2:241690/230‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGc > 1:447269/1‑183 (MQ=255) ggCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGc < 2:447269/183‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgc > 1:241690/1‑230 (MQ=255) tGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTCCTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGCCCGCCGTTTACTGGCTGACAtt > 1:68516/1‑289 (MQ=255) tGGAGGTAGGTATGTTGGTTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑AGTAGGCGCGGTATCGGGCATTGGATTGATGGCGCTAATGTGGATGATTCAGTTATGGTGGCAGGACTGGTTATGTTGGCTGGTCTTCTCGCTACTAAAAATTGGCCGGAGGTACGGCGGGCTTGTCGCGCTGACACAAGGGAAGTCGAGTACGGTGAGACTACCGCCCGCGGCTTACtcgactcgatt > 2:246429/1‑279 (MQ=255) | CGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGACGGGATGGCTATTTTCGCAACTTGAACTGTTTGATCTGCCTTATAACCAGTCTCCTTCGCTGCATATTATTCTCTGCTGGCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGA‑GGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCA‑TCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGAAACCTGATCAACGTCGAATCAAAATAGCACTGCCCTATGT‑CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGCCCGCCGTTTACTGGCTGACATT > NC_000913/1481171‑1481744 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |