New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4448489 = | 123 (1.050) | 13 (0.120) | 11/534 | 5.3 | 8.9% | coding (43/252 nt) | chpS | ChpS antitoxin of the ChpB‑ChpS toxin‑antitoxin system |
? | NC_000913 | 4448829 = | 147 (1.300) | coding (138/351 nt) | chpB | endoribonuclease toxin ChpB | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
CGCAAGTGAGCAACAATCAACTGATTCTGACACCCATCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACGCAGGGCGGAAATTTTGCCCGTTATGCCGGATTTAGCGTTCCTTTACATTGCGAAGAAGGCGATGTGCACGGCGTGGTGCTGGTGAATCAGGTGCGGATGATGGATCTACACGCCCGGCTGGCAAAGCGTATTGGTCTGG‑CTGCGGATGAGGTGGTGGAAGAGGCGTTATTACGCTTGCAGGCGGTGGTGGAATAAGGTGTGTTTATTTATCGCGGGC‑ATAAAAAAACCCTTACTAACCGAAGCCCGGCGTTCAGGGTTATTACGCCAGAA > NC_000913/4448547‑4449117 | cAAGTGAGCCACAACCAACTGATTCTGACACCAATCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCCGAACTTAGCCAGCAGGATGTACGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGGAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACCTTCTGCAGGTTGGCTTTGATCCAGCAACCGCCCATGAACAGCCAGGTGCTGGGCGACCTGCGCTTGGGCCATCCGTTCAAGCCATTAATCAGCTGGGAAAGACGCtgcggg > 2:757988/1‑284 (MQ=255) aaGTGAGCAACAATCAACTGGTTCTGACACCCAGCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGGCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGc < 2:451096/288‑1 (MQ=255) aaGTGAGCAACAATCAACTGATTCTGACACCCATCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGc < 1:993653/288‑1 (MQ=255) aaGGGAGCAACAATCAACTGATTCTGACACCCATCTCCAGGCGCTACTAGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGc < 1:38727/288‑1 (MQ=255) aaTCAACTGATTCTGACACCCATCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACGCa > 1:525717/1‑289 (MQ=255) cAACGGAGTCTGACACCCAACTCCAGGCGCTACGCGCTTGGTGAACGGCTGGCACAGTTGGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACAAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTTGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACGCAggg < 1:1024/289‑1 (MQ=255) cTGATTCTGACACCCATCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGACCAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACCCAggcagg > 1:809874/1‑285 (MQ=255) aTTCTGACACCCATCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACGCAGGGCGGaaa > 1:1017762/1‑289 (MQ=255) aTTCTGACACCCATCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGATGGTGGCCCCCATTACGCAGGGCGGaaa > 1:407760/1‑289 (MQ=255) tCTGACACCCATCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTCCGCAGGGCg > 2:648424/1‑283 (MQ=255) tCTGACACCCATCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACGCAGGGCg < 1:648424/283‑1 (MQ=255) cccATCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACGCAGGGCGGAAATTTTGCCCg < 1:904488/289‑1 (MQ=255) ccATCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGccc > 2:974277/1‑260 (MQ=255) aTCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACGCAGGGCGGAAATTTTGCCCGTTa > 1:662338/1‑289 (MQ=255) ggCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGCTCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTACTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATCACGCAGGGCGGAAATTGTGCCCGTTATGCCGGa > 1:189939/1‑289 (MQ=255) gcgcTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACGCAGGGCGGAAGTTTTGCCCGTTATGCCGGAt > 1:953349/1‑289 (MQ=255) agctatccGCTTGATGAACTGGTGGCACAGTGTGACATGAACGACGCGGAAGTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTCAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACGCAGGGCGGAAATTTTGCCCGTTATGCCGGa < 1:725244/280‑1 (MQ=255) gcTACTGGCTTGATGAACTGCTGGACAAGTGTGACAGGAACGCCGCGGAACTTAGCGGGGAGGATAGCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGGACGGGGAGACATGGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAGCAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGTCCCCCATTACGCAGGGCGGAAATTTTGCCCGTTATGCCGGAtt < 2:809874/288‑1 (MQ=255) tACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACGCAGGGCGGAAACTTGGCCCGTTATGCCGGAtttg > 1:53751/1‑287 (MQ=255) 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cATGCACGCCGCGTAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAATTCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGTAAAGTGAATTTGAACGGGGAGATATTGTGCTGGTTGGCTTTGCTCCAGCAAGCGGCCATGTACAGTATGTTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCTTTTAATCCACTGGGAATGACGTTGGTGGCCCCCATTACGCAGGGCGGCACTTTTGCCCGTTATGCCGGGTCTAGCGTTCCTTTACTTTGAGACGAGGGTGTTGTGc > 2:2281/1‑289 (MQ=255) cATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAACGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCACGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGATGGTGGCCCCCATTCAGCAGGGCGGCAATTTTGCCGGTACTGCCGTATTTGGCGTTCCTTGACATGCCGAAGAAGGCGAtgtac > 2:690181/1‑287 (MQ=255) aTGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACGCAGGGCGGAAATTTTGCCCGTTATGCCGGATTTAGCGTTCCTTTACATTGCGAAGAAGGCGATGTGCa < 1:454571/289‑1 (MQ=255) 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CGCAAGTGAGCAACAATCAACTGATTCTGACACCCATCTCCAGGCGCTACTCGCTTGATGAACTGCTGGCACAGTGTGACATGAACGCCGCGGAACTTAGCGAGCAGGATGTCTGGGGTAAATCCACCCCTGCGGGTGACGAAATATGGTAAAGAAAAGTGAATTTGAACGGGGAGACATTGTGCTGGTTGGCTTTGATCCAGCAAGCGGCCATGAACAGCAAGGTGCTGGTCGACCTGCGCTTGTGCTCTCCGTTCAAGCCTTTAATCAACTGGGAATGACGCTGGTGGCCCCCATTACGCAGGGCGGAAATTTTGCCCGTTATGCCGGATTTAGCGTTCCTTTACATTGCGAAGAAGGCGATGTGCACGGCGTGGTGCTGGTGAATCAGGTGCGGATGATGGATCTACACGCCCGGCTGGCAAAGCGTATTGGTCTGG‑CTGCGGATGAGGTGGTGGAAGAGGCGTTATTACGCTTGCAGGCGGTGGTGGAATAAGGTGTGTTTATTTATCGCGGGC‑ATAAAAAAACCCTTACTAACCGAAGCCCGGCGTTCAGGGTTATTACGCCAGAA > NC_000913/4448547‑4449117 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |