| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2566834 = | 186 (0.850) | 5 (0.020) | 4/470 | 17.4 | 2.7% | coding (51/1404 nt) | eutA | reactivating factor for ethanolamine ammonia‑lyase EutBC |
| ? | NC_000913 | = 2566830 | 183 (0.870) | coding (55/1404 nt) | eutA | reactivating factor for ethanolamine ammonia‑lyase EutBC | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
AGCGCCATCACCGCCGGGCGAGCATTGCGGGTTTTCGCGCTTTCACCGGTGATGAT‑GATGGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTACGCCGCCGATCAACTTGCCGACAATCATCGGGAAGATCATGGCGTTCATGTTGGCAGCGGCGAAGCCTAAGTGGTCGCCCAGGGCGAAAGCAGCGGAAACGGCGAAGGCGCAGTTGATGACTTTGCCGCGGGTATCCATCTGCTTCATCATGCCG > NC_000913/2566556‑2567118 | cgcCATCACCGCCGGGCGAGCATTGCGGGTTTTCGCGCTTTCACCGGTGATGAT‑GATGGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATCTTGCTCGAGTATTACGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGCCTTTGCCAGCTAATTTAGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCCGCGCCACCGCCGCACGGGTAACCCGCCCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGTGGGTGGGGGCGCCg > 2:925725/1‑289 (MQ=255) cgcCATCACCGCCGGGCGAGCATTGCGGGTTTTCGCGCTTTCACCGGTGATGAT‑GATGGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGcc < 2:254081/288‑1 (MQ=255) cgcCATCACCGCCGGGCGAGCATTGCGGGTTTTCGCGCTTTCACCGGTGATGAT‑GATGGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCGGGGTGGTTGTGGTGCCg > 1:880159/1‑289 (MQ=255) aTCACCGCCGGGCGAGCATTGCGGGTTTTCGCGCTTTCACCGGTGATGAT‑GATGGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGatat < 2:305938/289‑1 (MQ=255) cgGGCGAGCATTGCGGGTTTTCGCGCTTTCACCGGTGATGAT‑GATGGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCg < 1:707396/289‑1 (MQ=255) gggcgggcATGGCGGGTTTTCGCTCTTTCACCGGTGATGAT‑GATGGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCGCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTACACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGa < 2:711993/289‑1 (MQ=255) gggCGAGCATTGCGGGTTTTCGCGCCTTCACCGGTGATGAT‑GATGGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGGGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGa < 1:387783/289‑1 (MQ=255) atggCGTGTTTTCACTCTTTCACCGGT‑ATGATAGTTGGACCAAGAATAAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCGGCATAATCTTGCTCGAGTAATAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAACCCACCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAAGGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCTCGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCaa < 2:1481792/285‑1 (MQ=255) tttCGCGCTTTCACCGGTGATGAT‑GATGGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGTTATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGa < 1:1895932/289‑1 (MQ=255) tttCGCGCTTTCACCGGTGATGAT‑GATGGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGa < 1:770780/289‑1 (MQ=255) 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tCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGTAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGt > 1:2017371/1‑288 (MQ=255) tCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGACAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCCTCGTTTTTAGGTGCGGTCGCGt > 2:421253/1‑288 (MQ=255) aaTACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCg > 1:280804/1‑217 (MQ=255) aTGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTGCCGCTGCTTTAAAACCGCCCGGTTGATCGACAGGGGTAAAGAACGCCGGACTTGGCCAGCTAATTTCGCGTTTAAGGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACAGCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTAAATAGCTGGCGAGTATTCACGAGTGTGCCTCCGCTGCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGcatc < 1:2101979/288‑1 (MQ=255) tGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATcgcca > 1:1030693/1‑288 (MQ=255) cTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGa > 2:32018/1‑214 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |