| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2765420 = | 150 (0.690) | 6 (0.030) | 6/402 | 14.5 | 4.9% | intergenic (‑267/+93) | abpA/yfjM | CP4‑57 prophage; anti‑bacteriophage protein/CP4‑57 prophage; protein YfjM |
| ? | NC_000913 | = 2765411 | 109 (0.610) | intergenic (‑258/+102) | abpA/yfjM | CP4‑57 prophage; anti‑bacteriophage protein/CP4‑57 prophage; protein YfjM | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
CGCCTGAATCGTTCGACTCCATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGAT‑GTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACAC‑TTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCGTGTTCATGGCTTTCTATATTGTTGATGCCTTGCCCATCCGGACCCCACTCCTTATAGCTCATCATGATGGCTTGTTTTGGGCTCTCTGCTCGTTCTGTTTCGACGTAGAATTTTTTCTTGTCTG > NC_000913/2765132‑2765694 | cGCCTGAATCGTTCGACTCCATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGAT‑GTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatgg < 1:675854/289‑1 (MQ=255)cGCCTGAATCGTTCGACTCCATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGAT‑GTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatgg < 1:1458986/289‑1 (MQ=255)cGCCTGAATCGTTCGACTCCATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAAGAGAT‑GTTATGACCCAGTCCAATCGGGTCACTGCATCATCACCAGAGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTAGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatgg < 1:1748663/289‑1 (MQ=255) cTCCATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGAT‑GTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgccctatggcactatggcactatg > 1:1743744/1‑288 (MQ=255) aGACATCCGTGACAAATGTGCGAAAATGAAGGACATCGTTA‑GACACAGTACAATCGGCTCACTGCATCATCACCTGTCATCTCACTCCTTCCCATCCCTTCTCTGTCTCACGTATCAAGCTGTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGAAGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACAGCCAACCgcactatggcactatggcactatggcaatatgg < 2:1630869/289‑1 (MQ=255) ccGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGAT‑GTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggcactat > 1:1186801/1‑265 (MQ=255) cGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGAT‑GTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGAATTCCACAAATATTGTAACCCTTACGTATAATCTGGTTATATAATATACTACCCAAACTAAAGTAAGGTAAGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATATTTTAGAGCTAAAACCACCAACCgcactatggccatatggtactttggccctatggctatatg > 2:1811017/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |