New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 862446 = | 104 (0.910) | 3 (0.030) | 3/456 | NT | 3.2% | coding (161/2433 nt) | ybiW | putative pyruvate formate lyase |
? | NC_000913 | 862516 = | 82 (0.740) | coding (91/2433 nt) | ybiW | putative pyruvate formate lyase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CTTTTTGCTCATCGGTAAACATGCCGTAGCAGCGATCCTGTACGGTCTGACCGCGCCACCACGGGCACACTTCATGCAGAACGCGTTTGTTCTCTTCGCTCACCGCAAAGCCAGCACCGGGACGATCTGCCAGATCATCAATCTCTTTTTCGATCCACGAGACAGTATATTCCGGGAAGATCGGCGCGGCGCGAACTTCGCTTGCCTGGTTGCCAATGATCAACTCATCGTGTTTGATCCAGATGGTGCGATTCGCCAGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTTAATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGCAAAGTCGAGCAGTTCTGGCGCATCAAGCGGTTTTTCCGGGGCGTCATAGGGCAGATTAAGTA > NC_000913/862171‑862724 | acgcgctgcacgtgtgcgaaattcattttctgccccaccacacgctgggcatcaacaaatatcacttacttcatcttccctatgacgccccggaaaaaccgcttgaggcgccagaactgctcgaatgtgcccagcagtatgcctgccagaaagggtcaaccgcgaccttacgaggataacaaccatgaccacactgaaactggacacgctcagcgaccgcattaaagcgcacaaaaatgcgctggtgcatattgtgaaaccgccagtctgtaccgAgcgcg > 2:220906‑M1/276‑281 (MQ=255) agctgcacgttggcgaaattcattttctgccctaccacacgctgggcatcaacaaatatcacttacttaatcggccctatgacgccccggaaaaaccgcttgatgcgccagaactgctcgactttgcccagcagtatgcctgccagaaagggttaaccgcgaccttacgaggataacaaccatgaccacactgaaactggacacgctcagcgaccgcattaaagcgcacaaaaatgcgctggtgcatattgtgaaaccgccagtctgtaccgAGcgcgcg > 1:1076537‑M1/273‑280 (MQ=255) ccgtCGGTAAGCCTGCCGGAGCAGCGATCCTGTTCGGTCTGACCGCGCCACACCGGGCAACCTTCATGAAGAACGCGTTTGTTCTCTTCGCTCCCCGCAAAGCCAGCACCGGGACGATCTGCCAGAGCATCAATCTCTTTTTCGATCCACGAGACAGTATATTCCGGGAAGATCGGCGCGGCGCGAACTTCGCTTGCCTGGTTGCCAATGATCAACTCATCGTGTTTGATCCAGATGGTGCGATTCGCCAGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTAc < 2:975864/278‑1 (MQ=255) cGGTAAACATGCCGTAGCAGCGATCCTGTACGGTCTGACCGCGCCACCACGGGCACACTTCATGCAGAACGCGTTTGTTCTCTTCGCTCACCGCAAAGCCAGCACCGGGACGATCTGCCAGATCATCAATCTCTTTTTCGATCCACGAGACAGTATATTCCGGGAAGATCGGCGCGGCGCGAACTTCGCTTGCCTGGTTGCCAATGATCAACTCATCGTGATTGATCCAGATGGTGCGATTCGCCAGGTGATGAGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCggg > 1:667538/1‑281 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |