New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3248814 = | 115 (1.010) | 4 (0.040) | 4/452 | NT | 3.6% | coding (376/384 nt) | mzrA | modulator protein MzrA |
? | NC_000913 | 3248839 = | 106 (0.970) | intergenic (+17/‑130) | mzrA/yqjC | modulator protein MzrA/DUF1090 domain‑containing protein YqjC | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
AGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGAACATTGCCCCATGGCTACATCATTGCGCAGCAGGACAATAACAGTCAGGCTATGCAGTGGCTGACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAGCTATGCCGAAAAA > NC_000913/3248536‑3249088 | ccgtcaatacgattctggttttggtgtttttcggcatagctgatctccttaaggatattttgctccttttcctgacacagggtagtggcataactaccggcactaagagcaaagagagaaacagctaaagcgatgcggtatttcattcttgaaccttccattgtgattcggacctattacaaaggaacgattgtccagacaacgaagcggtagtgttaaccaccgcctcattaatcatagacagttacggtgaaatcaccaaagtgagtgatatgtTTCgg > 1:184323‑M1/277‑281 (MQ=255) aaaGAGTCTTCGATGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCACCACCTTGACGCTCATGGCATGCCTTTCAAAAGTATCACCCCC‑‑AAACTCCACTCTGTTAATTACATTTGACTACAGCGACCAGGGAGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGACCATTGCCCCATGGCTACATCATTGCGCAGCAGGACAATAACAGTCAGGCTATGCAGTGGCTGACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGa < 1:880712/279‑1 (MQ=255) ttcaatacggttctggttttggtttttttcggcataactgaactccttaaggatattttgcgccttttcctgacgcagggtagtggcataactaccggcacgaaaagcaaagagggaaacagctaaagcgatgcggtatttcattcttgaaccttccattgtgattcggacctattacaaaggaacggttgtccagacaacgaagcggtagtgttaaccaccgcctcattaatcatagacagttacggtgaaatcaccaaagtgagtgatatgtTTCGGAt > 2:344542‑M1/275‑281 (MQ=255) ttctggttttggtgtttttcggcatagctgatctccttaaggatattttgctccttttcctgacacagggtagtggcataactaccggcactaagagcaaagagagaaacagctaaagcgatgcggtatttcattcttgaaccttccattgtgattcggacctattacaaaggaacgattgtccagacaacgaagcggtagtgttaaccaccgcctcattaatcatagacagttacggtgaaatcaccaaagtgagtgatatgtTTCGGa > 1:530‑M1/265‑270 (MQ=255) cttgCGATTCGTGCCAGTCATCAAAGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTTGCATGACCTTGACGGTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACGCTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGAACATTGCCCCATGGCTACATCATTGCGCAGCAGGACAATAACAGTCAGGCTATGCAGTGGCTGACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTg < 2:590472/277‑1 (MQ=255) ggCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGACCATTGCCCCATGGCTACATCATTGCGCAGCAGGAACATAACAGTCAGGCTATGCAGTGGCTGACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCCGATAACTTCCTGTTa > 2:821212/1‑281 (MQ=255) cgattgcttcggTTCATCAGAGCACATCGATGCCCGACCGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCGCATTGCATTCCTTTCCAAAGTATCAACCCCAAAAACGAACCTCTGTTAATTACATTTAACTCCAGCGACCAGTGCGCCGCCGCGAAAGCGGTCCTAGACAGAACATTGCCCCGTGGCTATATCATTGCGCAGCAGGACAGTAACAGTCAGGCTATGCAGTGGCTGACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATc < 2:531383/270‑1 (MQ=255) 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atgcccccATGGCTACATCATTGCGCAGAAGGACAATTACAGTCAGGCTATGCAGTGGCTTACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACGTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTtctctc < 2:1193929/272‑1 (MQ=255) tGCCCCATGGCTACATCATTGCGCAGCAGGACAATAACAGTCAGGCTATGCAGTGGCTGACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCCCTCtt > 1:1193929/1‑276 (MQ=255) tGGCTACATCATTGCGCAGCAGGACAATAACAGTCAGGCTATGCAGTGGCTGACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCg > 1:723798/1‑157 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |