New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GCTGTTTTACGATCCGGCTGATATGGCGTGGCTGCGCCGTTGTCTGGAAGAGAAGCCGCAGGGGCAGTTGCAGGATATCGAGCGCCACAAACTCAATGCGATGGGCGCGTTTGCCGAAGCGCAAACTTGCCGTCGTCTGGTATTGCTGAACTATTTTGGCGAAGGGCGTCAGGAGCCGTGCGGGAACTGCGATATCTGCCTCGATCCGCCGAAACAGTACGACGGTTCAACCGATGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAAT‑CAGCGGTTTGGGATGGGTTATGT‑GGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCC‑GGTGCTGCGCGGCGAATCCTCTTTGCAACTTGCCGTGCCGCGTATCGTGGCGCTCAAACCGAAAGC > NC_000913/4006874‑4007428 | tGTTTTACGATCCGGCTGATATGGCGTGGCTGCGCCGTTGTCTGGAAGAGAAGCCGCAGTGGCAGTTGCAGGATATCGAGCGCCACAAACTCAATGCGATGGGCGCGTTTGCCGAAGCGCAAACTTGCCGTCGTCTGGTATTGCTGAACTATTTTGGCGAAGGGCGTCAGGAGCCGTGCGGGAACTGCGATATCTGCCTCGATCCGCCGAAACAGTACGACGGTTCAACCGATGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAAT‑CAGCGGTTTggg < 1:23786/281‑1 (MQ=255) 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tttttACGATCCGGGTGATATGGCGTGGCTGGGCCGTTGTCTGGAAGAGAAGCCGCAGGGGCAGTTGCAGGATATCGAGCGCCACAAACTCAATGCGATGGGCGCGTTTGCCGAAGCGCAAACTTGCCGTCGTCTGGTATTGCTGAACTATTTTGGCGAAGGGCGTCAGGAGCCGTGCGGGAACTGCGATATCTGCCTCGATCCGCCGAAACAGTACGACGGTTCAACCGATGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAAT‑CAGCGGTTTggg < 1:1127324/279‑1 (MQ=255) gATCCGGCTGATATGGCGTGGCTGCGCCGTTGTCTGGAAGAGAAGCCGCAGGGGCAGTTGCAGGATATCGAGCGCCACAAACTCAATGCGATGGGCGCGTTTGCCGAAGCGCAAACTTGCCGTCGTCTGGTATTGCTGAACTATTTTGGCGAAGGGCGTCAGGAGCCGTGCGGGAACTGCGATATCTGCCTCGATCCGCCGAAACAGTACGACGGTTCAACCGATGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAAT‑CAGCGGTTTGGGATGGGTTa < 1:1031438/281‑1 (MQ=255) cGGCTGATATGGCGTGGCTGCGCCGTTGTCTGGAAGAGAAGCCGCAGGGGCAGTTGCAGGATATCGAGCGCCACAAACTCAATGCGATGGGCGCGTTTGCCGAAGCGCAAACTTGCCGTCGTCTGGTATTGCTGAACTATTTTGGCGAAGGGCGTCAGGAGCCGTGCGGGAACTGCGATATCTGCCTCGATCCGCCGAAACAGTACGACGGTTCAACCGATGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAAT‑CAGCGGTTTGGGATGGGTTAtgt‑g > 1:124590/1‑281 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |