| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,720,076 | 0 | T | C | 5.4% | 243.0 / 2.7 | 84 | G67G (GGT→GGC) | slyB | outer membrane lipoprotein SlyB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/33); new base C (3/2); total (47/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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tataCTTTGACCATGAGGGATGCTTGCGTGGCGTTTCATGGTGAACAGGAGATTGTTCGATGATTAAACGCGTATTGGTTGTTTGAATGGTAGGTCTGTCTCTTGTCGGTTGTGTTAATAACGACACCCTGTCAGGGGATGTTTATACCGCTTCCGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTACCGGTACAATTGGCGGAGCTGTTCTTGGTGGTTTcc > 1:1031268/1‑279 (MQ=255) ttcTTTGTCCATGAGGGATGGTTGCGTGGCGTTTCATTGTTAACAGGAGTTTTTTCAATGTTTAAGCGCGTATTGGTTGTGTCAATGGTAGGTCTGTCTCTTTGCGGTTGTGTTAATTACTACACCCTGTCATGGGTTGTTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCAACATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTggg < 2:632551/279‑1 (MQ=255) tGACCATGAGGGATGCTTGCGTGGCGTTTCATGGTGAACAGGAGATTTTTCAATGATTAAACGCGTATTGGTTGTTTCAATGGTAGGTCTGTCTCTTGTCGGTTGTGTTAATAACGACACCCTGTCAGGGGATGTTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATa > 2:518623/1‑281 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |