| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,560,455 | +G | pseudogene (151/758 nt) | glpR ← | DNA‑binding transcriptional repressor GlpR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,560,455 | 1 | . | G | 97.9% | 865.5 / 2.2 | 234 | pseudogene (151/758 nt) | glpR | DNA‑binding transcriptional repressor GlpR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/1); new base G (113/116); total (117/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
GCTGCGTAATTCGCCACCGGCGAGAATGATGCGAAAATCTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑C‑CA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACGGCTAACCCGGCGATGTGTGCTCCGTTCGCCATCGACATCCCAAACAAA > NC_000913/3560169‑3560724 | cGTAATTCGCCACCGGCGAGAATGATGCGAAAATCTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCTGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACAGCCATGAGGG‑CGCA‑GGa > 1:1615086/1‑289 (MQ=255) gTAATTCGCCACCGGCGAGAATGATGCGAAAATCTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAACGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGCACTGAAAGGCAGCGCCGCATCGCCATGATGG‑CGCA‑GGa > 1:1063432/1‑288 (MQ=255) gTAATTCGCCACCGGCGAGAATGATACGAAAACCTTCTTTTACCATGAACGTGTTAGCAACGTGGAGTGTGTTGGTGAAAAGGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAACCAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGa < 2:316367/288‑1 (MQ=255) aaTTCGCCACCGGCGAGAATGATGCGAAAATCTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATc < 2:883486/288‑1 (MQ=255) cACCGGCGAGAATGATGCGAAAATCTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTACCCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGACACGGtttt > 1:316367/1‑288 (MQ=255) cGGCGAGAATGATGCGAAAATCTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCt > 1:1487110/1‑288 (MQ=255) gCGAGAATGATGCGAAAATCTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCCCCGCCATGATGG‑CGCA‑GGGACAGGTTTTGCTcc > 1:443791/1‑288 (MQ=255) agaATGGTGCGAAAATCTTCTTTTACCACCACCGTGTGAGCAACGTTGAGCTTGTTAGGGGAAATGCGACAATTGCTGTGATTG‑GCAATGGCGTGCGCGACCGTTTGCGGC‑GTGGTGCCGATATCGAGAAACAGGGTCGGGCCATTGGGGATTGGCTCCGCCACTTTGCGGGCGCTGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGcc < 2:152469/288‑1 (MQ=255) agaATGATGCGAAAATCTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGcc < 1:2208522/288‑1 (MQ=255) aaTGAGGCGAAAATGTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGAAACTTTGGGATTGTTGGGGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGGGCGCTACCGCTTCCGGG‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAg < 2:1819606/288‑1 (MQ=255) aaTCTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTc < 1:2007035/289‑1 (MQ=255) aTCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTTAGGTCGCGGCGAATAg > 1:1428251/1‑286 (MQ=255) cGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGGAAATTGCTGTTAGTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGTTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑Cggg < 1:1853607/289‑1 (MQ=255) cGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTcgc < 1:1315971/272‑1 (MQ=255) cGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCGGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑Cggg < 1:703555/289‑1 (MQ=255) gtgtTAGCAACGTTGGGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGGGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGc < 1:1705901/289‑1 (MQ=255) tAGCAACGTTGAGATTGTCGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGGAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGAGATGCGCTCTTTTTCTTAGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCAATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCCTTGGGGGCGCGGCGAATAGTTTG‑CGGGCTGAc > 1:1445945/1‑289 (MQ=255) aGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAACCAGCGTCGAGGCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCGCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTCGCGGTCGTGCGACGGCGTGTTAACCGAACTGGCAGGCGACGCCGCACCGCCATGTTGGCC‑CA‑GGGACAGTTTTTGATCCGCCAGCTCATTGCGCTCGCGGCGTATCGTCTG‑CCTGCTGACg > 2:889199/1‑289 (MQ=255) aGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTGCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACg > 1:2103336/1‑289 (MQ=255) aGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGACCGTGCCACGGCGTGTTAACCGCACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATCATGG‑CGCA‑GGATCAGGTCTTGCTCCGCCAGCCCATTGAGTTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACg > 2:268199/1‑289 (MQ=255) ggacattggagaTGTTTGGTGACAAGGCGAAAATTGCTGTGATTGGGCAGT‑GCGGGCGCTACCGCTGCGGGA‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATGGGGGATTTGCGCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACg < 2:1688049/280‑1 (MQ=255) aCGGTGAGATTGTTGGTTACAATGCGCAAATTGCTGGTATGGAGCAGT‑GCTTGCTCTACAGCTTCGGGC‑GTGGGGCCGATATCGGTAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGgaga < 2:2189017/289‑1 (MQ=255) cggtGAGATTGTTGCGGACAATGCGCAAATTGCTGTTAGTGAGCAGG‑GCGTGCGCTACCGCTGCCGGC‑GTGGGGCCGATTTCGATAAACAGCGTCGTGCCTTTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGCTGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACTGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGaa < 2:443791/286‑1 (MQ=255) cGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGc < 1:634220/239‑1 (MQ=255) ttGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCCACGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCCCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGCATCG‑CTGCCGGGGTGACGGAGCAAt > 2:1016960/1‑289 (MQ=255) gttgGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGTGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCCCCGCCAGCTCATTGAGGTAGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGCCGGAGAAATGCTCTAcc > 1:885071/1‑289 (MQ=255) ggTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGACGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGCGTAATGctcctgcc > 1:1688049/1‑282 (MQ=255) ggTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAg > 1:1703864/1‑288 (MQ=255) tGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCtt > 2:605000/1‑285 (MQ=255) gcAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTAc < 1:881259/288‑1 (MQ=255) aaTTGCGGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCG‑GGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACa < 1:231380/289‑1 (MQ=255) ggttGGGCTGT‑GCGGTCTCTACCGCTTCAGTC‑GTGGTGCAGATATCGATAAGCAGCGTCGAGCCATTTGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATTCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGGGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAGCTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGTTCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:1832869/286‑1 (MQ=255) gATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 1:1005783/288‑1 (MQ=255) gATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCCCCGCCAGCTCATTGAGGTCG‑GGCGAATCGTCTG‑CGGGCTGCCGGGGGGATGATCTGCCAGCTCTTAGGTCCTGaactacccccg > 2:231380/1‑278 (MQ=255) aTTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGCTATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGGCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGTACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTc < 1:1544372/222‑1 (MQ=255) gAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑cg > 1:176604/1‑182 (MQ=255) tggggtgtgCGACCGTTGCCGGC‑GTGGTGCCGGTATCGATAAACAGCGTCGGGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTaa < 2:1222275/284‑1 (MQ=255) t‑gcgtgcgCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCCGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTCCTCCGCCCGCGCATTGAGGTCGCGGCCAATAGTCTC‑CGGGCTTGCGTCGATATGCTCTAACCGGCCTTCGGTACTTACATAACCCTCCTGTTTCAcc > 2:292683/1‑289 (MQ=255) t‑gcgtgcgCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAAt < 2:1429012/222‑1 (MQ=255) t‑gcgtgcgCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAAcc > 1:2109827/1‑289 (MQ=255) ggcgtgggCTACCGCTGCCGGC‑GTGGGGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTGCGTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAAc < 2:1071124/287‑1 (MQ=255) gcgtgcgCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAAc < 1:826350/287‑1 (MQ=255) gcgtgcgCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCAATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCT‑GGATCAGGTTTTTCACCGCCAGCTCATTGAGGTAGCGACGCATa > 2:1544372/1‑222 (MQ=255) gcgcgcgcTTCCGCTTCGGGG‑TTGGTCCATATACCGATAACCAGCGTGTAGCCCTTGGGGTTTTGCTCCGCCACTTGGCGGGCGAGGCGCTCTTTTTCGTCGTTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCCCGGCGTGTTCACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAAcc < 2:1779172/288‑1 (MQ=255) cgtgcgCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCC‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCCCTACCAGCCTTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAg > 2:1494281/1‑289 (MQ=255) cgtgcgCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCGG‑CGGGCTGACGGAGAAATTCTCTACCCGCCCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAAcccg > 2:1256254/1‑287 (MQ=255) gtgcgCTACCGCTTCCGGG‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAg < 1:2130532/288‑1 (MQ=255) gtgcgCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAg < 1:745033/288‑1 (MQ=255) gtgcgCCACCGGTTCTGGCGGTGGTG‑CGATTTCGAGAAAACGCGTCGGGCCATTGGAGATTTGCTCCGCCTCTTGGCGGGGGATGCGCTCGTTGTCTGTGGGCGGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGAACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGTTCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAg < 2:1706078/288‑1 (MQ=255) ccacggtttCTGGG‑GTGGTACAGATATCGATAAACGGCGGCGATCCATTGGGGATTTGCTCCGCCAATTTGCGTGCGATTCGCTCTGTTTATTCGGTCTGGATGGCCTTGCGATCGTGCACCGGTGTGTTAACAGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCGCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGa < 2:100479/281‑1 (MQ=255) aCCGCTTCCGGC‑TTGGTGCCGATTTCGATAAACAGCTTCGGGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGTTGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGataa < 2:1703864/289‑1 (MQ=255) gCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGATCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATAc < 1:661599/289‑1 (MQ=255) cTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAAcc < 1:2210568/275‑1 (MQ=255) ttCCTGC‑TTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGTGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTTGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑TGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCTGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCg < 1:1841447/289‑1 (MQ=255) ggC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGc < 2:384947/214‑1 (MQ=255) ggC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGc > 1:384947/1‑214 (MQ=255) gtgCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCa > 2:2220989/1‑175 (MQ=255) gtgCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCt < 2:212546/209‑1 (MQ=255) gtgACGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCCCCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCGCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑AGGGATGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGGTCATACCGTTTTGACGtt > 1:363929/1‑289 (MQ=255) gATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGc > 1:1150704/1‑168 (MQ=255) gCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATaa > 1:1506807/1‑289 (MQ=255) gCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGGTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa > 1:1935633/1‑221 (MQ=255) cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCCCGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCCCCGCCATGATGG‑CGCC‑GGACCAGGTTTTGCTCCGCTAGCTCATTGCGGGCACGGCGAATAGCATG‑CGGGCTGACGGATAACTGCATTACCAGCTCTTGCGTTCTGACATAAACCTGCCGGTTAACCAGTTCGTTAATACCGTTGTTACTTTTTGTTGGGTTCATTTATtaa > 2:1019276/1‑289 (MQ=255) cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGCTGG‑C‑GACGGATCAGGTTTTTCTCCGCCCGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CCGGCTGACGGATAAATTCTCTACCTGCTCTTCGGTACTGACCTAACCCTGCCTTTTAACCCGATCCATACTACCGTTTTGACTTTGTTTTTGTTTCATTTATaaa > 2:2265852/1‑289 (MQ=255) cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGgaga < 2:739085/197‑1 (MQ=255) cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCAGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCCACCAGCTCTTCGGTACTGACa > 2:860138/1‑226 (MQ=255) cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGAGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGACCAGGTTTTGCTCCGCCAGCCAATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CCGGCTGACGGAAAAATTCACTACCTACTCTTCGGTACTGACCTAAGCCGGCTGTTTAACCAGCTCGACAATCCCGCTGTGACGTTTGGTTTGTTTCAATTATaaa > 2:1974234/1‑289 (MQ=255) gTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACg > 2:1120117/1‑266 (MQ=255) gTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACg < 1:1120117/266‑1 (MQ=255) aGCCATTGGGGCTTTTCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑TGATCAGGTTTTGCTCCGACAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATTCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATACGCCTTCTGTTTAACCAGTTCGataata > 2:1728404/1‑251 (MQ=255) aGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGataata < 1:850352/251‑1 (MQ=255) aGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATTAATc > 1:1386930/1‑286 (MQ=255) aGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑CGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCCGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATc > 1:1454573/1‑286 (MQ=255) aTTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTAttt > 1:481425/1‑288 (MQ=255) tCCGCCCCTTTGCTGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGTCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTAttttcgtttt < 1:1019270/289‑1 (MQ=255) cGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGataata < 1:1816250/232‑1 (MQ=255) ttGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa < 2:908559/189‑1 (MQ=255) tGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAg > 1:582316/1‑124 (MQ=255) ggtaTGCGTCCTTTTTCTGCGGTCTGGGGGGGCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGGTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGa < 2:1386930/285‑1 (MQ=255) aTGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTtg < 1:1234272/222‑1 (MQ=255) aTGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTtg > 2:1234272/1‑222 (MQ=255) ttttCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTcgcg > 1:269011/1‑122 (MQ=255) tttCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCa < 2:504725/289‑1 (MQ=255) ttctttcggctgtggTGTCCTTGCGATGGTGCCCCGTCTGTTTAACCGAACTGGAAGGGAGCGCCGCACCGCCATGGTGGTG‑CA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATCAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCa < 2:1818110/276‑1 (MQ=255) tcGGTCTTGGTGGCCTTGCGATCGGGCCACGGGTTGTTAACCGGACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCt < 2:1451631/289‑1 (MQ=255) gTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACTTAACCCTGATATTTAACCAGTTCGATAATCCCGTTGTGACGTTGCGTTTGTTTCTTTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGTGCATTTAGCCAATCAACaaaaccactagataa > 2:2025456/1‑277 (MQ=255) gTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTaa > 1:1819084/1‑288 (MQ=255) tGGGGGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAAccc < 1:535306/289‑1 (MQ=255) ggTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGCTCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGGTTAACCAGGTAGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGACTTATTTTCGTTTTCGCTCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCAACGCTCAAccaaa > 2:1597725/1‑286 (MQ=255) ccTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTAc < 2:2106739/153‑1 (MQ=255) cTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACGGCTa < 1:20834/288‑1 (MQ=255) cGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACGGCTAACCCg > 2:713972/1‑289 (MQ=255) gCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGATCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACGGCTAACCCGGCGATGTGTGCt > 1:189907/1‑288 (MQ=255) gtgtTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACGGCTAACCCGGCGATGTGTGCTCCg < 1:1556315/289‑1 (MQ=255) aCTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACGGCTAACCCGGCGATGTGTGCTCCGTTCGCCATCg > 1:1969433/1‑288 (MQ=255) aCTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACGGCTAACCCGGCGATGTGTGCTCCGTTCGCCATCg > 1:349694/1‑288 (MQ=255) ccgcACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:578637/120‑1 (MQ=255) ccgcACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACGGCTAACCCGGCGATGTGTGCTCCGTTCGCCATCGACATCCcaaacaaa > 1:2229816/1‑288 (MQ=255) cACCGCCATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGgag < 2:844020/80‑1 (MQ=255) ccATGATGG‑CGCA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGtgtttgtt > 2:1477517/1‑157 (MQ=255) | GCTGCGTAATTCGCCACCGGCGAGAATGATGCGAAAATCTTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGT‑GCGTGCGCTACCGCTTCCGGC‑GTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑C‑CA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTG‑CGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACGGCTAACCCGGCGATGTGTGCTCCGTTCGCCATCGACATCCCAAACAAA > NC_000913/3560169‑3560724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |