| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 399248 = | 128 (0.920) | 3 (0.020) | 3/490 | 13.9 | 2.9% | coding (86/309 nt) | yaiY | inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 399640 = | 74 (0.550) | coding (48/213 nt) | yaiZ | DUF2754 domain‑containing protein YaiZ | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGGTGTGATACCAGCGGCTTATGGCAAGTCTGACAGGTCATTTAGATTGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGT‑GGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATCCGCAGCGTGACGCTCCAGCGCCAGTTCAATCAAACGTGTGATCAGATCGGTGTAACCCAGACC > NC_000913/399365‑399918 | tGGTGTGATACCAGCGGCTTATGGCAAGTCTGACAGGTCATTTAGATTGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTAGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGAGGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCAt < 2:1013272/281‑1 (MQ=255) tgATACCAGCGGCTTATGGCAAGTCTGACAGGTCATTTAGATTGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGcc > 2:130266/1‑281 (MQ=255) gATACCCGCGGCTTATGGCAAGTCTGACAGGTCATTTCGATTGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTACCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCt < 1:1056519/281‑1 (MQ=255) aTACCAGCGGCTTATGGCAAGTCTGACAGGTCATTTAGATTGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCtt > 1:132538/1‑281 (MQ=255) cTTATGGCAAGTCTGACAGGTCATTTAGATTGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATattcattc > 1:164771/1‑281 (MQ=255) gCAAGTCTGACAGGTCATTTAGATTGTCAATATCAGAAGCATGGTAAATTAAAGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCAAAAAATAGCAACCTTAAGTTAAATATATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCAATTGGCCTTATATTCATTCTTAATg < 1:478736/281‑1 (MQ=255) ttGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGAttt > 2:1349824/1‑281 (MQ=255) gAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGCAGCTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCTTGACTGGTACTACTATGCGTTCGCCATTGGACTTATCATCATTCTTCATGGCGGGGGGGGGTTACTGGGATTGGAAGCAAAAgg > 2:251230/1‑280 (MQ=255) aaTCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAgg > 1:837880/1‑279 (MQ=255) aaTCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAgg > 1:172006/1‑279 (MQ=255) 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1:374872/1‑251 (MQ=255) tCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGT‑GGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATCCGCAGCGTGACGCTCCAGCGCCAGTTCAATCaaa < 2:374872/251‑1 (MQ=255) tCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGT‑GGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATCCGCAGCGTGACGCTCCAGCGCCAGTTCAATCAAACGTGTGATCAGATCGGTGTAACCCAGAcc > 1:443721/1‑280 (MQ=255) tCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGT‑GGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATCCGCAGCGTGACGCTCCAGCGCCAGTTCAATCAAACGTGTGATCAGATCGGTGTAACCAAGAcc > 1:612957/1‑280 (MQ=255) 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TGGTGTGATACCAGCGGCTTATGGCAAGTCTGACAGGTCATTTAGATTGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGT‑GGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATCCGCAGCGTGACGCTCCAGCGCCAGTTCAATCAAACGTGTGATCAGATCGGTGTAACCCAGACC > NC_000913/399365‑399918 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |