Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 129,798 | A→T | 9.1% | I488N (ATC→AAC) | yacH ← | DUF3300 domain‑containing protein YacH |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 129,798 | 0 | A | T | 9.1% | 290.8 / 2.1 | 107 | I488N (ATC→AAC) | yacH | DUF3300 domain‑containing protein YacH |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/43); new base T (4/7); total (55/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.50e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGC‑GAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTG‑CCTCTCTTCGCTGCTGGATCTTC‑GGGTTAGTCTGCATTCTCTCGCGAACTGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGATAACGCTGACGAGCGGCGTCCTTTTGTTGCTGGGTCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAG > NC_000913/129519‑130074 | aaCTTTCTCCCGAAAAAGCTGTCCTGGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTGGCTGTGGATGCAGTGGGCGCTGCTGGACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGAGGCGGACTGAATACGCTCACGCGCGGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTGTCTCGC‑GAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTG‑CCTCTCTTCGCTGCTGGATCTTC‑ggg < 2:561429/280‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |