New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2442521 = | 83 (0.760) | 6 (0.060) | 6/510 | 9.5 | 6.4% | coding (758/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme |
? | NC_000913 | 2442624 = | 95 (0.900) | coding (861/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTAGATGCCTGGTTTCTGGACGGCTTTGCGCCAGCGAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGG‑CCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGGGCGCTGTATCCGTTATTAAGCAAACACGATGAGGCGCTAAACCGCTTTTTCTCTAATGCGTTTACTTTTGCTCGTCGGTTTTACGACCAATTACCCGTTAAATTTGATCAT > NC_000913/2442243‑2442801 | gACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTAGATGCCTGGTTTCTGGACGGCTTTGCGCCAGCGAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCTGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGGTGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCCCcgcc > 2:340575/1‑282 (MQ=255) ccAGCCAACGGGACGATTCGCTAAATCAAAGAGTGGATGCCTGGTTTCTGGACGGCTTGGCGCCAGCTAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGcc < 1:567328/283‑1 (MQ=255) tGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTAGATGCCTGGTTTCTGGACGGCTTTGCGCCAGCGAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTac > 2:35367/1‑282 (MQ=255) tGGACGATTCGCTAAATCAAAAAGTAGATGCCTGGTTTCTGGACGGCTTTGCGCCAGCGAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATCCACGATGCAAAAACCGAAGGGCTTTGGGCGAAAACGGGAAATGCATTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCTCGCCGTGGTTTaa > 1:484076/1‑283 (MQ=255) gACGATTCGCTAAATCAAAAAGGGGGTGGGTGGTTGCTGGACTGCTGTGCGCCAGCGAAAACCCCGGAGTGGCGGACG‑AAAAATCTGTTTAAGGCCCCGGAAAGGTTGGCGCGTTCGGGCGGCACGCTGGCGACCTTTACGTGTGCCGGTGTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGGCGCCCGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGAGGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTa < 2:393911/280‑1 (MQ=255) ttCGCTAAATCAAAAAGTAGATGCCTGGTTTCTGGACGGCTTTGCGCCAGCGAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAAGGCTTTGCGGTGTGATGGAACAGACATTACCGATCCCCTGCCCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACg > 1:190927/1‑283 (MQ=255) gCTAAATCAAAAAGTAGATGCCTGGTTTCTGGACGGCTTTGCGCCAGCGAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACggg < 1:538748/282‑1 (MQ=255) tAAATCAAAAAGTAGATGCCTGGTTTCTGGACGGCTTTGCGCCAGCGAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTCGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCCAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAACCGGGCAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTTCCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCTCACGGgcag > 2:343488/1‑283 (MQ=255) aaaTCAAAAAGTAGATGGCGGGTTTCTGGACGGCTTTTCGCCAGCAAAAAAACCGGATATGTGGACG‑CAAAATCGGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGgcagc < 2:584569/283‑1 (MQ=255) gATGCCTGGTTTCTGGACGGCTTTGCGCCAGCGAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAACCGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTTCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAg > 1:722339/1‑283 (MQ=255) 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ggcagtcGAAAAGCCCGGTTAGGGTGACC‑GAAAATCTGTGTAACGCCATGGCAAGATTGGCTCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGCCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg < 1:575738/276‑1 (MQ=255) aGCGAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGCGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTTCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCCCCGCGCCGTGGGTTAACCGCCCGGGACGCGCCAAACGGGAAGGGGCGATCATCGGGGGGGGGATGGcac > 2:958391/1‑279 (MQ=255) gCGAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGACATGCCTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCCCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCCGCAGCCAACGGGACGCGGCGCATATCGGCGGGGGGATTGCCAacg > 1:1003393/1‑283 (MQ=255) gCGAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCCCGGGCAGCAGCAAACGGGACGCGGCGATTATCGGCGGTGGTTTTGCCGgcg > 2:804933/1‑283 (MQ=255) gCGAAAAACCCGGATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGGGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCCGCGGGGGTTAACCGCACGGGCAGCAGCACACGGGCAGCGGCGATTATCCGCGGTGGGATTGGCAgag > 2:821045/1‑281 (MQ=255) gAAAAACCCGGATATGTGGACT‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAgcgc < 1:616768/282‑1 (MQ=255) ggATATGTGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCACGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCCTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGCGGTGATGGAACAGCCATTACCGCTCCCCTGCCCCGCCCCGTGGTTTAACGGCACGGGCATCAGCACACGGGACGCGGCAACTATCGCCGGCGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTc > 2:236174/1‑282 (MQ=255) gttatGGGGACGCCAAAATCTGTTAGACGCCGTGGCAGGGGTGGCGGGGCCGGGGGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGGCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCg < 2:896543/281‑1 (MQ=255) ttaggtgGACC‑CAAAATTTGGTTAACGCCAGGGCAAGGTGGGGGCGGCCGGGCGGCCGGCTGGCGACATGTACGTCTGCCGGTTGTTGCCGCCGCGGGTTGCAGGACTCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAATGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAAGGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCTTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCt < 2:692907/279‑1 (MQ=255) atatGGGGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCt < 2:88665/283‑1 (MQ=255) tgGACG‑CAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGACCAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCCGCCCGCTGTTTTCgggtgcg > 2:352028/1‑276 (MQ=255) tGTTTAACGCGATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCgg < 1:273873/283‑1 (MQ=255) tGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGGGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCGGGCGCCATTACGGCGCgg > 1:440855/1‑283 (MQ=255) tttAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGAAGCAAACGGGCAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTTCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCt > 1:458085/1‑283 (MQ=255) ttAAGGCCATGGCAAGGTGGGCCGGGCCTGGGGGCACGCGGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTg < 2:808610/283‑1 (MQ=255) tgtaCGCCTTGGCAAGGTTGGCTCGTCCGGGCGGCAAGCTGGCGACAGTTACGGCGGCAGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTg < 1:958391/280‑1 (MQ=255) tGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCGGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGGTGCGGTTACAGGCGGTGGGATTGCCCGCGGCTCGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCGGGGAGGTGAc > 2:744073/1‑283 (MQ=255) ggCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCCACCCTGCCCCGCGCCGTGGGTTAACCGCACGGGCAGCAGCCAACGGGCAGCGGCGATTATCGGCGGGGGGATTGCCAGCGCGCTGTTCGCGCTGGCGCGTTTCAGGCGCGACTCGCCGGTACGGCTCTCTTgc > 1:477793/1‑283 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |