Predicted mutation | ||||||
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JC | NC_000913 | 4,076,776 | Δ12 bp | coding (631‑642/873 nt) | yihY → | putative inner membrane protein |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 4076788 = | 1 (0.010) | coding (643/873 nt) | yihY | putative inner membrane protein |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
ATGTACTCCATCGATAGCGCGTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTG‑CTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGA‑TCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTT‑CTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTCGCGCTTTATATCACCATGTTCCCGTCATATCAGCTCATTTATGGTGTGCTGGCGGTGATCCCCATTCTCTTTGTTTGGGTCTACTGGACATGGTGTATCGTCTTGCTTGGCGCGGAAATTACTGTCACTCTCGGGGAATACCGCAAACTAAAACAAGCAGCTGAACAAGAAGAAGACGACGAACCATGATTGCATTAATTCAACGCGTAACCCGTGCCAGCGTCAC > NC_000913/4076494‑4077055 | aTGTACTCCATCGATAGCGCGTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTG‑CTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGA‑TCTCAATCCTGTCATCGACCACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTT‑CTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCG > 1:717593‑M1/1‑282 (MQ=255) 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tCGATAGCGCGTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTG‑CTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGA‑TCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTA‑TTTTCCGGTGGCGTTGTCGGGGGTCCCCTTCCTGTTTGTTTTAC‑GGATTGTTCCTAACCTCCGCGTTCCTAAACGCGCCCCGtttgtcgc > 1:39895‑M1/1‑271 (MQ=255) aTAGCGCGTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTG‑CTCTCCCTGCGCTGGGCGCGCGA‑TCTCCATACTGTCATCTACAACGTGTGGCGTATTTTACCGTTGCCGTTGTCGTGGATCTCCTT‑CTGGTTCCTGTACAGCATTTTTTCTACCCTCCGCGTACCCACCCGCCACGGGtttgtcgtcgcca > 2:660287‑M1/1‑269 (MQ=255) cgcgTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTG‑CTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGA‑TCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTT‑CTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGtttgtcgccgcactcctg > 1:18082‑M1/1‑265 (MQ=255) 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aaaaaTTTGCTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTG‑CTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGA‑TCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTT‑CTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGtttgtcgccgcactcctgttcgaagcaggaaagaaaggtttcgcgctttatatcacc < 1:356715‑M1/283‑58 (MQ=255) tgtACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTG‑CTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGA‑TCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTT‑CTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGtttgtcgccgcactcctgttcgaagcaggaaagaaaggtttcgcgctttatatcaccatgttcccgtcatatcagct < 1:138192‑M1/283‑78 (MQ=255) tGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTG‑CTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGA‑TCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTT‑CTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGAGTACCTAACCGCGACGCGtttgtcgccgcactcctgttcgaagcaggaaagaaaggtttcgccctttatatcaccatgttcccgtcatataaccccattt > 2:218505‑M1/1‑201 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |