New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2655876 = | 119 (1.300) | 5 (0.060) | 4/498 | 8.8 | 3.9% | coding (483/1284 nt) | pepB | aminopeptidase B |
? | NC_000913 | 2656032 = | 127 (1.410) | coding (327/1284 nt) | pepB | aminopeptidase B | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
ATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAGCCCCATATAACCTTGCTCAC‑GCAGATCTTCGCCTTTGGTGATCCGATAAGTCACACGATCGCCCGCGACGTTGCTGATCAGATCAACAGCA‑CGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATTCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCACACCACTTTACGCGTGCCTTTCGGGGCTTTGTAACCTTGCCAGAATGCCCAGCAG > NC_000913/2655604‑2656149 | aTCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACtgtgt > 1:646144/1‑274 (MQ=255) aGGTTATCCGCACAGCAAACGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCCCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAg < 1:631638/275‑1 (MQ=255) ggTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCCCGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGAAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAg < 1:283243/274‑1 (MQ=255) ggTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCATTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCACCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAg < 1:40076/274‑1 (MQ=255) ttATCCCCACGTCAGGGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCTTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGTTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAGcc < 2:460075/274‑1 (MQ=255) aTCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGCGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAGcccc > 1:537761/1‑274 (MQ=255) aTCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAGcccc > 1:244011/1‑274 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |